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Romain Causse

Résistance aux inhibiteurs de l'ALS: gare aux dicots ! Après le coquelicot et les matricaires, la stellaire fait de la résistance

SPE GEAPSI

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New polymorphic markers for genetic diversity studies in an invasive plant: the common ragweed (Ambrosia artemisiifolia L.)

Common ragweed is an annual herb that belongs to the Asteraceae family. It is known as an invasive plant originating from the USA. In France the common ragweed is especially abundant in the Rhône-Alpes basin and currently spreads northwards in Burgundy. Ragweed colonizes different types of environments, such as railways, river sides, wastelands, farmlands and cultivated crops (especially sunflowers crops). Herbicide resistance to linuron, glyphosate and/or acetolactate synthase inhibitors has been reported in the USA, which complicates the chemical control of ragweed. In addition, the highly allergenic pollen of ragweed causes severe allergies. These elements make this plant a major threat …

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Chapter 7 Biogeographic patterns of fish

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Le séneçon commun résiste aux inhibiteurs de l’ALS

SPE Pôle GEAPSI; Contexte - Suite à des échecs ou des difficultés de désherbage du séneçon commun à l’aide d’herbicides inhibiteurs de l’ALS (groupe HRAC B) en blé ou en vigne, l’hypothèse de la présence d’une résistance a été étudiée. Etude - Des tests biologiques ont été effectués sur trois populations provenant de deux parcelles « à problèmes » de blé et d’une de vigne. Des tests PCR ont ensuite permis de rechercher la présence de mutations causant une résistance aux herbicides inhibiteurs de l’ALS dans trente-trois parcelles de blé et treize parcelles de vigne supplémentaires. Résultats - Les tests biologiques ont montré l’existence d’une résistance à tous les inhibiteurs de l’ALS étudi…

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Population genetics on Ambrosia genus: past, present and future

National audience; A new Task Force within the COST-SMARTER has recently been created. This group is composed of population genetics experts from five European countries in charge of focusing on “Genetics on Ambrosia” (Austria, France, Germany, Hungary, Sweden). Their mission was to review molecular methods used in published genetics studies on common ragweed and to discuss about future projects. Two different types of molecular markers are generally used in the literature to investigate the genetic structure within and between introduced and/or native populations of common ragweed: microsatellite markers and amplified fragment length polymorphism (AFLP). These methods permit the researcher…

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Next-Generation Sequencing (NGS) application to the detection of mutations endowing herbicide resistance

The Next Generation Sequencing (NGS) technologies offer tremendous possibilities for accurate detection of mutations endowing resistance. Yet, their use for this purpose has not emerged in crop protection. We aim at promoting NGS use for herbicide resistance diagnosis. In an exemplary study, we describe a simple procedure for this purpose, useable by virtually any scientist and implementing freely accessible programs for the analysis of NGS data. Three PCR amplicons encompassing seven codons of the ALS gene that are crucial for herbicide resistance were sequenced using non-quantified pools of crude DNA extracts from 40 plants in each of 28 field populations of two species of barnyard-grass:…

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Résistances aux herbicides : panics dans le riz !

SPE GEAPSI CT1; Des difficultés de désherbage à l’aide d’herbicides inhibiteurs de l’ALS (groupe B du HRAC) ayant été notées en riziculture, en Camargue (France), sur des panics, l’hypothèse d’une sélection de résistance a été étudiée. Des prélèvements ont été effectués sur 28 parcelles à raison d’une feuille de 40 plantes différentes par parcelle. Des tests ADN ont permis d’identifier les espèces en présence. Puis des tests PCR ont permis de rechercher la présence de mutations entraînant des résistances aux herbicides inhibiteurs de l’ALS. Vu le nombre d’analyses à réaliser (7 codons sur 40 plantes x 28 parcelles), le séquençage « 454 » a été utilisé. Deux espèces de panics ont été identif…

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Résistances aux herbicides : les estivales en force !

Contexte - Des cas de moindre efficacité de désherbage à base d’herbicides inhibiteurs de l’ALS ont été signalés en cultures de printemps. Des tests ont été réalisés pour savoir s’il s’agit de résistances et, si oui, dues à quel mécanisme. PSD sur maïs - Cinq populations de graminées estivales (deux de panic pied-de-coq, une de sétaire verte, deux de digitaire sanguine) ont été prélevées dans des parcelles de maïs où le désherbage n’avait pas donné satisfaction. Des plantes résistantes ont été identifiées dans toutes ces populations. Le mécanisme a été identifié. Il s’agit dans tous les cas de RNLC, résistance non liée à la cible. Ambroisie - Une dizaine de populations d’ambroisie à feuille…

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