Implication de l'UMR 1347 Agroécologie dans des recherches sur le semis direct sous couvert

National audience

Les systèmes en semis direct sous couvert : Impacts de l'abandon du travail du sol et des couverts sur la flore adventice ?

Les systèmes de culture conduits en semis direct sous couvert sont basés sur une réduction totale du travail du sol et une couverture du sol maximale (couverts, mulch). Les modifications d'habitats induites par la mise en place de ces pratiques peuvent agir sur la composition qualitative et quantitative de la flore adventice des cultures, en particulier lorsque la période d'inter-culture est longue (succession cultures d'hiver-cultures d'été). Matériel & Méthodes : La flore spontanée de cultures de blé d'hiver et de soja a été suivie sur une vingtaine de parcelles. Des relevés selon un itinéraire en W sur une zone de 2000m2 ont été réalisés à 2 (soja) ou 3 (blé) périodes pendant l'année cul…

Modélisation de la composition qualitative des communautés d'adventices en fonction des variables du milieu

National audience

Invasive and native populations of common ragweed exhibit strong tolerance to foliar damage.

8 pages; International audience; Tolerance and resistance are defence strategies evolved by plants to cope with damage due to herbivores. The introduction of exotic species to a new biogeographical range may alter the plant herbivore interactions and induce selection pressures for new plant defence strategies with a modified resource allocation. To detect evolution in tolerance to herbivory in common ragweed, we compared 3 native (North America) and 3 introduced (France) populations, grown in a common garden environment. We explored the effect of leaf herbivory on plant vegetative and reproductive traits. Plants were defoliated by hand, simulating different degrees of insect grazing by remo…

How rare arable weeds are descriptors of low farming intensification?

International audience; Recent emphasis has been placed on the rapid destruction of the planet’s biodiversity in allhabitats. Rare arable weeds, also known as segetal plants, are threatened species, mostly indecline due to intensive farming systems. However, the presence of these species is intrinsicallylinked to agroecosystems. Their survival is apparently related to low-input agronomic practices.Could these weeds therefore be good descriptors of low agricultural intensification and be goodindicators of high environmental field value? We propose to examine the relationships between thefarming systems and weed flora sampling in the same fields.

Résistance du vulpin aux herbicides. Son importance et sa répartition en Côte d'Or

BlACKGRASS lN WHEAT: A MAP OF HERBICIDE RESISTANCE Since the years 1990, the spread of herbicide resistance in wheatis more and more important within weed species as blackgrass (Alopecurus myosuroidesHuds,). Resistanceto the fenoxaprop-P-ethyl within blackgrass population wasfirst was detected in the Côte d'Or departement. ln this context, a map of the herbicide resistance of blackgrass was undertaken at the scale of this departement. 149 fields were used for this study with for each an agronomic investigation and harvests of blackgrass seeds. Almost the whole of the populations of blackgrass tested present at least 50% of plants resistant to fenoxaprop-P-ethyl, and 53% and 9% of these popu…

Jusqu’où réduire l’usage de pesticide sans dégrader la productivité et la rentabilité de l’exploitation ?

prod 2017-301 SPE EA GESTAD DOCT INRA; National audience; Le suivi des fermes du réseau Dephy, créé entre 2010 et 2012 dans le cadre du plan Écophyto, permet, d’ores et déjà, d’évaluer les possibilités de réduire la dépendance aux pesticides : – en analysant les pratiques actuelles (en comparant les exploitations entre elles) ; – mais également en simulant des évolutions sur des scénarios réalistes. L’analyse de 946 fermes du réseau travaillant en agriculture conventionnelle montre la complexité des liens entre indicateur de fréquence de traitement (IFT) global de l’exploitation (système de culture), la productivité (exprimée en énergie produite) et la rentabilité (marge semi-nette). Il en …

Weed-DATA Base de données ‘Traits’ des plantes adventices des agroécosystèmes

SPEEAECOLDURGEAPSIéquipe CAPA; absent

Arable-weed flora and its pollen representation: A case study from the eastern part of France

International audience; Local pollen deposition in human-influenced vegetation types is studied with the aim of establishing the relationship between arable-weed vegetation and its pollen representation as an aid in interpreting human presence and impact on vegetation from pollen assemblages. The study area is located in the Franche-Comté region, eastern part of France. The presence of plants within 100 m2 plots and their pollen representation in moss samples within the same plots was recorded from different crops and annual fallows. Patterns in the vegetation and pollen assemblages were investigated separately using principal coordinate analysis (PCoA). Procrustean co-inertia analysis (PCI…

Biodiversité des champs et services écosystémiques : comment décrire la flore adventice ?

La mise en place de nouveaux modes de gestions des parcelles agricoles (système biologique, agriculture de conservation), renforce l'intérêt présenté par la description de la flore spontanée pour la production de services écosystémiques. Cependant sa description pose de nombreux problèmes. En 2017, 39 parcelles ont été échantillonnées avec deux relevés de flores réalisés avant (mars) et après (juin) le désherbage de printemps. Deux méthodes ont été comparées : i) estimation par note d'abondance de la flore par un parcours en W sur une zone de 2000 m² (Itinéraire 1) et ii) estimation par un comptage par 10 quadrats de 0,25 m² sur la diagonale de la zone précédemment évaluée (Quadrat 1). Just…

La résistance du vulpin des champs aux anti-graminées dans les blés en France. La métabolisation : son importance crée une situation à risque

National audience; La résistance du Vulpin aux anti-graminées inhibiteurs de l'acétyl-coenzyme carboxylase ACC],« fops » et « dimes ») constitue un problème de désherbage majeur en France. 243 populations de vulpin (116 essentiellement dans le nord-est de la France, 127en Côte-d'Or) ont été analysées à l'aide de tests biologiques de sensibilité à des inhibiteurs de l'ACC et de tests moléculaires d'identification de résistances de cible. Des résistances ont été identifiées dans 241 des 243 populations. L'essentiel (plus de 75%) des résistances aux deux « fops» les plus utilisés est dû à des résistances par métabolisation.Ces résistances sont les plus préoccupantes en terme de gestion chimiqu…

L'ambroisie : chronique de l'extension d'un polluant biologique en France

National audience

Dynamique spatio-temporelle des communautés végétales dans les agro-écosystèmes

National audience; Identifier les déterminants de la structuration des communautés adventices est une question cruciale en agro-écologie, au vu des différentes fonctionnalités de cette flore dans l’agro-écosystème – un impact potentiellement négatif sur le rendement agricole mais aussi une valeur de nature patrimoniale comme fonctionnelle, en tant que base de nombreuses chaines trophiques en milieu agricole. En réponse à des moyens de lutte chimique efficaces, la flore adventice a largement décliné au cours des dernières décennies et reste aujourd’hui soumise à des pressions anthropiques récurrentes qui affectent la distribution spatiale des communautés dans la mosaïque agricole. A l’échell…

Long-term assessment of integrated weed management cropping systems in France

Modélisation GLM de la présence/absence de quelques espèces de mauvaises herbes en fonction de variables du milieu

National audience

Ambroisie à feuilles d'armoise : une enquête sur son passé

National audience

Cinq élues et des candidates : enquête sur les mauvaises herbes envahissantes en grandes cultures en France

National audience

Pesticides sur blé tendre d'hiver, diversité dans le détail

Contexte -L’analyse des pratiques d’application des pesticides (herbicides, fongicides, insecticides, ré-gulateurs) sur le blé tendre d’hiver (BTH) a été réalisée à partir de données d’en-quêtes annuelles sur une petite zone agricole en Côte-d’Or. Etude - L’étude a porté sur 294 parcelles appar-tenant à 13 exploitants pour la période 2004-2011. L’indice retenu pour carac-tériser l’usage des pesti-cides est l’IFT (indice de fréquence de traitements).

How does functional diversity of plant assemblages reduce growth response of the invasive species Ambrosia artemisiifolia L. ?

Analyse exploratoire graphique des données : un exemple d'utilisation d'Analyst

National audience

La flore des milieux rudéraux et sa représentation pollinique : une nouvelle approche pour la reconstruction de l'environnement humain

National audience

Weed flora evolution in direct seeding under cover systems

Direct seeding under cover, by its emergent properties, raises new questions of research on weed communities. The absence of soil disturbance and the implementation of cover crops, modify all factors of conventional agriculture and lead to a complete change of habitat for and management of the weed flora. In addition, these systems allow the development of a certain number of animal communities that interact with one another and with plant communities and thus potentially promote the regulations expected in Agroecology. Finally, there is the issue of annual weed species diversity in systems where tillage is strongly reduced. This thesis, started in November 2017, has as main objective to pr…

Variabilité génétique, d’histoire de vie et d’infection des populations de l’orobanche rameuse en France

L'orobanche rameuse est une Angiosperme holoparasite épirhize qui infecte une large gamme de cultures annuelles. Selon la culture hôte, la durée de son cycle peut varier de 14 semaines (sur tomate/tabac) à 40 semaines (sur colza). Nous avons mené une expérimentation d'infections croisées afin d'évaluer l'intensité et la cinétique d''infection de populations d'orobanche. Deux populations du parasite, P-long collectée sur le colza et P-short collectée sur le tabac, ont été cultivées sur deux cultures (colza et tomate). Après, 4, 8, 12 et 16 semaines de culture, l'intensité d'infection et la distribution des stades de développement de l'orobanche ont été déterminées. Les deux populations d'oro…

New approach to quantify in situ storage protein bodies in M. truncatula immature seeds

Grain legumes play a worldwide role as a source of plant proteins for feed and food. During seed mid-maturation (16-20 DAP), a semi-quantitative analysis of vicilin (globulin7S) accumulation was assessed in the model legume M.truncatula. The populations of vicilincontaining protein bodies are distinguished by their number and size which allowed proposing a model of their biogenesis. Two distributions were detected, enabling a separation of their processing at early and mid maturation stages. The largest protein bodies corresponding to mature vicilin aggregations which have probably reached their final size were shown to be formed by the fusion of the small bodies. This approach using a comb…

Infestation de Rhamphicarpa fistulosa (Hoschst.) Benth. en riziculture de bas-fonds au nord du Togo

International audience; Le riz constitue de nos jours la base alimentaire de plus de 2,5 milliards de personnes en Afrique subsaharienne où sa demande ne cesse de croître. Pour faire face à cette demande qui dépasse souvent doublement les productions nationales, et pour diminuer ses importations sans cesse croissantes, le Togo à l’instar des pays ouest-Africains a élaboré un document stratégique qui mise sur l’extension et la productivité des rizières de bas-fond. Malheureusement, les bas-fonds rizicoles en Afrique tropicale sont souvent confrontés à la pression des adventices et plus particulièrement des adventices parasites de la famille des Orobanchaceae. Rhamphicarpa fistulosa, plante h…

Étude des communautés adventices et semis direct sous couvert – méthodologies et premiers résultats

L’estimation des changements de flore liés à la mise en place d’un nouveau type de système de culture pose des questions sur le type d’échantillonnage à réaliser. Si les relevés de type « parcours » sur une zone de la parcelle semblent les plus satisfaisants pour capter les changements de diversité spécifique, le choix du nombre et de la période de relevés pose encore question afin d’obtenir des jeux de données les plus satisfaisants possibles pour répondre aux objectifs fixés

Can a historical analysis of the spread of Ambrosia artemisiifolia explain its actual success in France ?

International audience

Analysis of relationships between farming practices, weed flora and crop production

International audience; Quantitative data on the potential losses of crop yield due to weeds is limited. Approaches toquantify weed damages considered only individual weed species, and have not included thecompounding of effects at the community level. Moreover they did not integrate the influence ofagricultural practices and environmental variables on the weed-crop relationship. Here weanalysed a big data sets to study relations between crop management, weed communities’indicators and crop yield and then develop path analysis models to disentangle the confoundingeffects of cropping system on weeds and crop production. Flora surveys (N= 651) were performedfrom 2006 to 2013 on 150 fields in …

Analyse des effets direct et indirect des pratiques agricoles sur les adventices et la production de blé tendre d’hiver

Analysis of direct and indirect effects of farming practices on weeds and winter wheat yield. Farmers implement farming practices to maximize production by limiting biotic (e.g. weeds) and abiotic (e.g. nutrient) growth factors. Our study aimed to quantify direct and indirect (through a change of weed pressure) effects of farming practices on yield. We analysed the relationships between farming practices, weeds and yield of 152 wheat fields located in the study site of Fénay (UMR Agroécologie, Dijon) using partial least square path modelling (PLS-PM). Our results showed that farming practices had a positive direct effect on crop productivity (β = 0.32). Farming practices decreased weed pres…

Evaluating field-scale sampling methods for the estimation of mean plant densities of weeds

The weed flora (comprising seven species) of a field continuously grown with soyabean was simulated for 4 years, using semivariograms established from previous field observations. Various sampling methods were applied and compared for accurately estimating mean plant densities, for differing weed species and years. The tested methods were based on (a) random selection wherein samples were chosen either entirely randomly, randomly with at least 10 or 20 m between samples, or randomly after stratifying the field; (b) systematic selection where samples were placed along diagonals or along zig-zagged lines across the field; (c) predicted Setaria viridis (L.) P. Beaux seedling maps which were us…

Regional study of herbicide resistance of Alopecurus myosuroides Huds. in France

International audience; Since the 1990s in the north-west of Europe, the spread of herbicide resistance in wheat weeds such as Alopecurus myosuroides Huds. (blackgrass) is becoming more and more important. In the French administrative district Côte d’Or resistance to fenoxaprop within A. myosuroides populations was first detected in 1996. In 2003, 149 fields from this district were randomly sampled and about 125 A. myosuroides populations were tested for herbicide resistance. The agronomic history of all sites was investigated. Most the populations of A. myosuroides investigated contained at least 50 % of plants with resistance to fenoxaprop. In 53 and 9 % of these populations at least 50 %…

Faire un CodeBook avec Rstudio

SPE Pôle EcolDur Le R1ciam est un groupe de travail de l'INRA. Le site web a pour objectif d'aider à l'utilisation de R dans toute sa diversité, de l'administration, à la mise en œuvre ou l'implémentation de méthodes mathématiques et statistiques La fiche technique est mise à jour sur le site web.

Contrasted integrated weed management systems reduce reliance on herbicides and lead to various dynamics of weed communities

Evolution de la flore adventice en semis direct sous couvert

Vérification et analyse préliminaire des données : utilisation raisonnée des tableurs

National audience

Symbiosis-related plant genes modulate molecular responses in an arbuscular mycorrhizal fungus during early root interactions.

To gain further insight into the role of the plant genome in arbuscular mycorrhiza (AM) establishment, we investigated whether symbiosis-related plant genes affect fungal gene expression in germinating spores and at the appressoria stage of root interactions. Glomus intraradices genes were identified in expressed sequence tag libraries of mycorrhizal Medicago truncatula roots by in silico expression analyses. Transcripts of a subset of genes, with predicted functions in transcription, protein synthesis, primary or secondary metabolism, or of unknown function, were monitored in spores and germinating spores and during interactions with roots of wild-type or mycorrhiza-defective (Myc–) mutan…

Le package plyr (1)

SPE EcolDur Le R1ciam est un groupe de travail de l'INRA. Le site web a pour objectif d'aider à l'utilisation de R dans toute sa diversité, de l'administration, à la mise en œuvre ou l'implémentation de méthodes mathématiques et statistiques La fiche technique est mise à jour sur le site web.; Le package plyr est proposé par Hadley Wickham. Il offre de nombreuses fonctions permettant de manipuler et de traiter des objets R et plus particulièrement des tableaux (data.frame), des listes (list) et des matrices (array). Parmi toutes les fonctions proposées, on trouve un grand nombre de fonctions construites sur le modèle des fonctions apply(). Ces fonctions de type **ply() seront traitées dans …

Weed community of lowland rice system in northern Togo's Savannah region

International audience; Weeds are the major biotic constraint for lowland rice production systems in Togo, particularly in the Savannah region where rice cultivation follows traditional practices with very little mechanization or synthetic pesticide treatment. In order to identify and categorize weed flora of this agricultural system, vegetation surveys were conducted in Northern Togo’s lowlands during the growing seasons of 2012 and 2013. Full floristic surveys were conducted in 33 lowland sites, selected for their accessibility and importance in terms of rice production. A total of 97 weed species from 26 plant families were recorded in 2012 against 103 weed species in 28 families in 2013…

Evolution de la flore adventice en système de culture utilisant le semis direct sous couvert végétal

Développé en France à partir des années 2000, le semis direct sous couvert regroupe des systèmes de culture répondant à certaines conditions : l’absence de travail du sol, une couverture maximale du sol et une rotation diversifiée. Cette forme d’agriculture, considérée comme la plus aboutie de l’agriculture de Conservation, constitue, en France, une stratégie très innovante. Le semis direct sous couvert, par ses propriétés émergentes, suscite de nouveaux questionnements de recherche qui mobilisent aussi bien l’agronomie que l’écologie. D’un point de vue agronomique, l’adoption du semis direct sous couvert implique, pour les agriculteurs, une modification importante de leur raisonnement et r…

Enquête semis direct sous couvert végétal transition agronomique et évolution des problèmes malherbologiques

National audience; Une équipe de l’Inrae de Dijon (UMR Agroécologie) a enquêté sur la pratique du semis direct sous couvert et ses effetssur l’évolution de la flore adventice. Une enquête nécessaire, à laquelle a participé TCS. En voici les résultats.

L'orobanche rameuse. Une plante parasite dont la variabilité s'avère complexe

EASPEEcolDurGEAPSICT1; National audience; L'orobanche rameuse (Phelipanche ramosa (L.) Pomel) est une plante connue pour parasiter préférentiellement la tomate dans les pays du bassin méditerra-néen, le tabac et le chanvre en Europe centrale. Mais le colza semble être un nouvel hôte préférentiel avec une augmentation du nombre de parcelles infectées en Bulgarie, Espagne, France et Italie. Pourquoi cette orobanche inquiète Une expansion massive sur colza En France, on observe une expansion massive de cette espèce dans les parcelles de colza depuis la fin des années 1990.

Automatiser la production de fiches : exemple de création d'un atlas botanique

Extension d'Ambrosia artemisiifolia L. dans le département de la Côte d'Or

International audience

Les vignettes

Les Task views et le package ctv

SPE EcolDur Le R1ciam est un groupe de travail de l'INRA. Le site web a pour objectif d'aider à l'utilisation de R dans toute sa diversité, de l'administration, à la mise en œuvre ou l'implémentation de méthodes mathématiques et statistiques La fiche technique est mise à jour sur le site web.; Les Task views sont des compilations, regroupant par grands thèmes/disciplines, les packages R jugés les plus pertinents pour le thème ou la discipline. Ces compilations proposent une offre documentée et régulièrement mise à jour de ce qu'il est utile/nécessaire d'installer pour commencer rapidement un nouveau thème.

Conservation agriculture : how farmers manage weeds

International audience; Conservation agriculture is characterized by the continuousand simultaneous application of three principles:minimum soil disturbance (no-tillage), residue cover onthe soil surface (dead mulch or cover crop) and diversecrop successions and cover crop mixes. Adopted inFrance by farmers since the 1990s, this farming systemstill faces some challenges to its adoption, particularlyfor weed management. To highlight this problem,425 French farmers practicing conservation agriculturewere surveyed by an online survey. Cultural practicesused to manage weeds during the first years of conservationagriculture were requested. The use of each culturalpractices was first studied inde…

La nuisibilité directe des adventices en grandes cultures : quelles réponses nous apportent les essais désherbages ?

The direct harmful effect of weeds in field crops : what do herbicide trials tell us ? Weeds are plants whose undesirable qualities (“harmfulness") outweigh their desirable qualities (trophic resources). Few studies conclude that weeds do not affect crop yield. However, it is difficult to generalize since weeds compete with crops for resources and these resources are spatially and temporally variable. This study analyzed 110 herbicide trials (untreated vs. treated plots) performed in France from 1993 to 2015 on three major grain crops: winter wheat, winter oilseed rape and sunflower. Significant yield losses were found in 92% of wheat trials (average over all trials: -2.6 t/ha), 51% of wint…

Influence du type de jachère annuelle sur la flore adventice des cultures suivantes

National audience

Structure and evolution of resistance to acetyl-coenzyme A carboxylase-inhibiting herbicides across the geographical range of the grass weed A. myosuroides Huds. (black-grass)

International audience

Exemple d'organisation et de gestion informatique d'une bibliothèque d'unité

National audience

Orobanche rameuse du tabac (Phelipanche ramosa L.) : Identifier de nouvelles solutions conventionnelles et de biocontrôle

The branching broomrape, Phelipanche ramosa L. is an obligate parasitic plant, which in a few years became a major agronomic problem for tobacco crops in France. Two approaches, aiming at controlling broomrape were tested within the framework of the ELIOT project grouping Arvalis, the CT2F cooperative and the INRA center of Dijon. The first relates to sulfonylurea herbicides, including rimsulfuron and sulfosulfuron and a systemic herbicide of the cyclohexanediones family, clethodim. The results, although instructive, do not reflect an effective control of broomrape. The second approach deals with the search for soil-borne fungi that are pathogenic to broomrape. A large number of fungal stra…

Comment compter, noter les adventices ?

Prod 2018-236k SPE pole EA GESTAD INRA

Formation à la statistique. FPSTAT2. Analyse multidimensionnelle des données

* INRA Département de biométrie, Domaine de Vilvert, 78350 Jouy en Josas cedex Diffusion du document : INRA Département de biométrie, Domaine de Vilvert, 78350 Jouy en Josas cedex; National audience

Quelles adventices en agriculture de conservation des sols ?

Enquête sur les mauvaises herbes envahissantes en France

National audience

Quelles pratiques agricoles pour la conservation des plantes messicoles ?

Evolution des problèmes malherbologiques à l’adoption du semis direct sous couvert

Le semis direct sous couvert regroupe un ensemble de pratiques appliquées simultanément en vue de répondre à trois principes : réduction totale du travail du sol, couverture optimale des sols et diversification de la succession culturale. Cette approche représente, en France, une stratégie innovante qui semble convaincre de plus en plus d’agriculteurs. En se privant du travail du sol, la gestion des adventices en semis direct sous couvert devient plus complexe, ce qui limite l’adoption généralisée du semis direct sous couvert. Afin d’éclairer les problèmes malherbologiques rencontrés en semis direct sous couvert, un questionnaire en ligne à destination des agriculteurs a été diffusée en Fra…

Créer des documents avec le package R.rsp

SPE EcolDur Le R1ciam est un groupe de travail de l'INRA. Le site web a pour objectif d'aider à l'utilisation de R dans toute sa diversité, de l'administration, à la mise en œuvre ou l'implémentation de méthodes mathématiques et statistiques La fiche technique est mise à jour sur le site web.; Le package R.rsp utilise un langage de balises. Il permet la construction automatique de documents contenant du texte et des résultats/figures issus de l’exécution de blocs de code R. Par rapport aux autres packages du même type (Sweave, knitr par exemple), il présente l’avantage, de gérer la répétition au travers de boucles, de blocs de texte et de code R. Il est aussi utilisable avec un plus grand n…

XML : un moyen simple d'utiliser les données structurées sous Internet Explorer

National audience

Development of a combined spatial and spectral method for weed detection and localisation

National audience

Le package manipulate de Rstudio

SPE EcolDur Le R1ciam est un groupe de travail de l'INRA. Le site web a pour objectif d'aider à l'utilisation de R dans toute sa diversité, de l'administration, à la mise en œuvre ou l'implémentation de méthodes mathématiques et statistiques La fiche technique est mise à jour sur le site web.; Le package manipulate, installé en même temps que RStudio, propose une fonction permettant de construire des graphiques interactifs. Relativement simple à mettre en place, la fonction propose 3 contrôles permettant de modifier la valeur de certains objets contenus dans le code produisant les graphiques.

Différences de capacités d’induction de la germination de deux pathovars d’orobanche rameuse sur une gamme d’hôtes des familles des brassicacées et fabacées

Branched broomrape (Phelipanche ramosa (L.) Pomel) is a holoparasite weed causing significant yield losses on several crops, especially in France on winter oilseed rape fields. The ability to induce germination of seeds of branched broomrape, variable between host species, represent an important information to identify the status of weed species present in the crop (host or non-host). In this study, conducted in in vitro conditions, we focused on two botanical families and two dominant pathovars of branched broomrape in France. We show that the host species is the only important explanatory factor of seed germination rate, the latter being not affected by the pathovar. Among the species stu…