Statistical Validation of a Comprehensive Gene/miRNA Expression Profile Dataset for miRNA:mRNA Interaction Analysis

Statistical validation of a comprehensive gene/miRNA expression profile dataset for miRNA:mRNA interctome analysis

Cellular stress positively regulates the expression of Myc promoter-Binding Protein-1 (MBP-1).

Dal trascrittoma all’interattoma di miRNA: identificazione sperimentale e bioinformatica delle interazioni funzionali miRNA:mRNA

I miRNA, piccole molecole endogene di RNA non codificante, regolano l’espressione genica attraverso la degradazione dei messaggeri (mRNA) o l’inibizione della traduzione. I miRNA maturi interagiscono con le proteine del complesso RISC (RNA-induced silencing complex) tra cui le proteine Argonaute (Ago), capaci di legare direttamente i miRNA e di mediare la regolazione dell’espressione genica in seguito alla interazione del miRNA con il proprio mRNA target. Un singolo miRNA può legare diversi mRNA e ciascun mRNA può essere regolato da diversi miRNA. La maggior parte dei software di predizione oggi disponibili individuano i putativi target di singoli miRNA ignorando caratteristiche di tipo glo…