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Spor Aimé
Artificial selection of root microbiota associated to plant phenotype changes
International audience; Artificial selection applied at community level is an important, but still growing topic in the field of ecology andexperimental evolution [1-3]. Its recent implementation to microbial communities holds not only appealingpromises in terms of fundamental knowledge about selection itself [3], but also in terms of relevant applicationsto our society, including bioremediation [4] and plant traits enhancement [5]. Here we transposed the conceptof artificial selection of communities to perform experimental evolution of root microbiota inducing relevantphenotypic changes in plants. We grew ten successive generations of four weeks old Brachypodiumdistachyon inoculated with a…
Antibiotrophie : une fonction émergente favorisant l’implantation des bactéries antibiorésistantes dans les sols
National audience; La fonction antibiotrophique, permettant l’utilisation d’antibiotiques comme source nutritive, arécemment été découverte chez des bactéries antibiorésistantes environnementales. Pourvérifier si leur avantage sélectif en environnements pollués s’en trouvait augmenté, nous avonsconduit une expérience en microcosmes dans laquelle Microbacterium sp. C448 (C448),présentant des capacités de résistance et de dégradation vis-à-vis des sulfamides, a été inoculéedans quatre sols supplémentés ou non par l’antibiotique sulfaméthazine (SMZ) et/ou du lisier.Après un mois d’incubation, C448 n’a été détectée que dans les sols traités avec la SMZ,indiquant une faible compétitivité de la s…
Nouveaux outils en bioremédiation : prédiction du potentiel de dégradation d’une communauté à partir de sa composition et création de communautés multidégradantes par coalescence
En bioremédiation, la bioaugmentation consiste en l’introduction de microorganismes dans un milieu contaminé afin d’augmenter et/ou de suppléer la population bactérienne en place, dans l’objectif de le dépolluer. Cette approche est cependant limitée par la difficulté de choisir des microorganismes efficients - communauté ou souche spécifique – à inoculer, en lien avec les conditions abiotiques et les microorganismes indigènes du milieu pollué.Dans ce travail nous avons cherché à prédire le potentiel microbien de dégradation de deux pesticides, le glyphosate et l’isoproturon, de communautés microbiennes telluriques en utilisant des méthodes statistiques issues de la prédiction génomique. Pou…