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AUTHOR
Tiffany Raynaud
Artificial selection of microbial communities: the effect of diversity and the role of interspecific interactions
In agriculture, the plants and animals that are bred come from long-term artificial selection procedures that aim at producing individuals with desirable traits. Such procedures can be applied at levels of biological organization higher than the individual such as the community level, which is of particular interest in the field of microbial community engineering. Indeed, microbial communities play key roles in agriculture but also in the environment, health and industry, and a growing body of literature shows promising results regarding the artificial selection of microbial communities for desirable functions. However, for artificial selection procedures at the community level to be effici…
Sélection artificielle de communautés microbiennes : effet de la diversité génétique et rôle des interactions interspécifiques
National audience; La sélection artificielle, à l'origine des espèces animales et végétales utilisées en agriculture, alongtemps été appliquée à l’échelle de l’individu. Il est possible de transposer cette procéduresur des holobiontes, communautés ou écosystèmes ; toutefois, cela ajoute un niveau decomplexité puisque le phénotype cible de la sélection résulte de la présence de plusieurs espèceset, potentiellement, de leurs interactions. L'ambition de ce projet est i) de déterminer si unediversité génétique microbienne élevée permet d'améliorer l'efficacité de la sélection artificiellede communautés microbiennes et ii) de déterminer si les interactions entre espèces sontimpliquées dans la mi…
Effets des interactions entre diversité végétale inter et intraspécifique et communautés microbiennes du sol sur les propriétés de l’écosystème - Candidature à la bourse Phytomic
National audience; Le lien entre diversité et fonctionnement d’un écosystème ainsi que les mécanismes sous-jacents sont très étudiés en génétique des populations et en écologie des communautés et des écosystèmes. La première s’attèle à décrire les effets de la variabilité génétique intraspécifique sur différentes propriétés écosystémiques tandis que la deuxième s’intéresse aux interactions écologiques au niveau interspécifique. Notre objectif est de faire le lien entre ces deux champs disciplinaires par l’étude des effets conjoints d’une mobilisation de la diversité végétale intra et interspécifique et de la diversité microbienne sur les propriétés de l’écosystème. Nous avons mesuré différe…
Effet de la diversité génétique sur l’efficacité de la sélection artificielle au niveau de la communauté : comment sélectionner des communautés microbiennes qui maximisent la fourniture d’azote aux plantes ?
National audience; La sélection artificielle, à l’origine des espèces animales et végétales d’intérêt agronomique, est classiquement exercée au niveau de l’individu, voire des gènes. Cependant, appliquer cette sélection au niveau supra-individuel permet l’accès à des sources de variation phénotypique supplémentaires introduites par les interactions inter-individuelles. Dans les procédures de sélection artificielle au niveau des communautés, comme dans les procédures classiques, la diversité tend à s’éroder au cours du temps ce qui peut altérer l’efficacité de la sélection. L’objectif de ma thèse est de déterminer comment la diversité génétique influence l’efficacité de la sélection artifici…