0000000000824043
AUTHOR
Maija Ustinova
"15 Latvijas pilsētu notekūdeņu metagenoma taksonomiskais un funkcionālais raksturojums"
Neattīrīti notekūdeņi ir ķīmiski un bioloģiski kompleksa vide, taču tā mikrobioloģiskais sastāvs līdz šim ir maz pētīts. Izmantojot šobrīd pieejamās sekvencēšanas un bioinformātikas tehnoloģijas, ir iespējams raksturot notekūdeņu mikroorganismu kopienas sastāvu dažādos līmeņos. Bakalaura darba mērķis bija taksonomiski un funkcionāli raksturot 15 Latvijas pilsētu notekūdeņu metagenomus. DNS tika izdalīta no neattīrītu, 24 h periodā ievāktu koncentrētu notekūdeņu paraugiem, un tai, izmantojot lielapjoma paralēlo sekvencēšanu, tika veikta visa metagenoma analīze. Datu analīzes rezultātā tika noskaidrots, ka pilsētu notekūdeņu metagenomos ir saskatāmas līdzības sugu, ģints, tipa un gēnu līmeņos…
Dominating taxonomic composition of the early life gut microbiota and influencing factors in infants up to seven months of age in Latvia
Abstract It has been hypothesised that the establishment of stable adult microbiota is programmed in infancy, and therefore early life gut colonisation may lead to a lifelong microbiota pattern with significant effects on health. The aim of the study was to analyse the composition of gut microbiota and influencing factors in infants up to seven months of age in Latvia. A cross-sectional study was performed at primary healthcare centres. The parents of healthy infants filled out a questionnaire and brought the child’s faecal sample. 16 rRNS gene sequencing was performed to identify the bacterial taxonomic units. The composition of gut microbiota was compared between children with different r…