0000000000888873
AUTHOR
Kristīne Soboļevska
Prostatas vēža pacientu audzēju un bioloģiskos šķidrumos atrodamo ārpusšūnas vezikulu transkriptomu salīdzinājums
Visdažādāko veidu šūnas izdala ārpusšūnas vezikulas (EVs) un ir pierādīts, ka tām ir nozīmīga loma prostatas vēža (PCa) attīstībā, jo tās spēj pārnest dažādas bioloģiskās molekulas, tostarp RNS, no vienas šūnas uz otru. Šis darbs ir vērsts uz plazmas un urīna EV, kā arī PCa audzēja un normālu prostatas audu transkriptoma izpēti, izmantojot RNS sekvencēšanas (RNA-seq) tehnoloģiju. Rezultāti uzrādīja, ka 1868 proteīnus kodējošie gēni un 1108 garās nekodējošās RNS (lncRNS) bija paaugstināti ekspresētas audzēja audos salīdzinājumā ar normāliem prostatas audiem, taču tikai 6% līdz 31% proteīnus kodējošie gēni un 1% līdz 5% lncRNS bija atrodamas EVs, kas liecina, ka EV ietvertā RNS saturs tikai d…
Mazo RNS raksturošana ārpusšūnas vezikulās, kas iegūtas no prostatas vēža pacientu urīna un plazmas paraugiem
Ārpusšūnas vezikulas (EVs) nodrošina starpšūnu komunikāciju fizioloģiskos procesos un dažādās saslimšanās, ieskaitot ļaundabīgos audzējus. EV RNS satura izpēte dotu iespēju atklāt jaunus prostatas vēža (PCa) biomarķierus. Šis darbs tiek fokusēts uz mazo RNS raksturošanu, kas iegūtas no PCa pacientu plazmas un urīna EVs, kā arī no PCa un normāliem prostatas audiem, izmantojot RNS sekvencēšanu. Rezultāti uzrādīja, ka gan plazmas, gan urīna EVs satur matrices RNS fragmentus, mikro RNS, garās-nekodējošās RNS, piwi-saistošās RNS un citas nekodējošās RNS, taču to proporcijas ievērojami variē starp indivīdiem. Daļa šo RNS ir paaugstināti ekspresētas vēža audos un varētu būt piemērotas kā PCa bioma…
Detection of circulating miRNAs: comparative analysis of extracellular vesicle-incorporated miRNAs and cell-free miRNAs in whole plasma of prostate cancer patients.
Abstract Background Circulating cell-free miRNAs have emerged as promising minimally-invasive biomarkers for early detection, prognosis and monitoring of cancer. They can exist in the bloodstream incorporated into extracellular vesicles (EVs) and ribonucleoprotein complexes. However, it is still debated if EVs contain biologically meaningful amounts of miRNAs and may provide a better source of miRNA biomarkers than whole plasma. The aim of this study was to systematically compare the diagnostic potential of prostate cancer-associated miRNAs in whole plasma and in plasma EVs. Methods RNA was isolated from whole plasma and plasma EV samples from a well characterised cohort of 50 patient with …