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Experimental evolution of genome architecture and complexity in an RNA virus
2016
Introducción La evolución de la arquitectura del genoma – las dimensiones y la organización del material hereditario de un organismo – es poco conocida. Existe una variación asombrosa en la arquitectura genómica entre diferentes organismos. Los virus tienden a tener genomas pequeños, con un mínimo de secuencias intergénicas y típicamente con genes solapantes, los cuales se cree son una forma de compresión del genoma que permite al virus incrementar su número de proteínas sin aumentar su tamaño. Los procariotas tienen genomas compactos, pero con secuencias intergénicas más largas que los virus, y los genes con solapamientos largos son escasos. Los eucariotas presentan una amplia gama de tama…
Emergence and Phylodynamics of Citrus tristeza virus in Sicily, Italy
2013
Citrus tristeza virus (CTV) outbreaks were detected in Sicily island, Italy for the first time in 2002. To gain insight into the evolutionary forces driving the emergence and phylogeography of these CTV populations, we determined and analyzed the nucleotide sequences of the p20 gene from 108 CTV isolates collected from 2002 to 2009. Bayesian phylogenetic analysis revealed that mild and severe CTV isolates belonging to five different clades (lineages) were introduced in Sicily in 2002. Phylogeographic analysis showed that four lineages co-circulated in the main citrus growing area located in Eastern Sicily. However, only one lineage (composed of mild isolates) spread to distant areas of Sici…