Genomic epidemiology: from transmission to the evolution of pathogenic microorganisms

La epidemiología genómica ha revolucionado el mundo microbiano. Sus aplicaciones permiten conocer y comprender mejor el comportamiento, la transmisión y la evolución de los microorganismos. A pesar de su gran y reconocido potencial, su uso aún es limitado, especialmente en regiones en desarrollo. El principal objetivo de esta tesis fue estudiar y analizar los genomas completos de tres microorganismos patógenos y zoonóticos para comprender mejor su epidemiología, potencial patogénico y evolución. En el primer capítulo caracterizamos a nivel genómico a Salmonella enterica aislada de alimentos, fincas y muestras clínicas en Ecuador. Además, presentamos evidencia de la presencia de factores de …