6533b82dfe1ef96bd129224a

RESEARCH PRODUCT

Mycobacterium avium kompleksa baktēriju daudzveidības salīdzinājums Latvijā atrastajos cilvēku un cūku izolātos

subject

description

Mycobacterium avium kompleksa (MAC) baktērijas dažkārt tiek izolētas no Latvijas plaušu slimniekiem kā fons tuberkulozes saslimšanām. Atšķirībā no tuberkulozes MAC slimnieku epidemioloģiskā izsekošana Latvijā netiek veikta. Tomēr literatūrā tiek minēts, ka kopīgs infekcijas avots var tikt atrasts vidē. Līdztekus tiek uzskatīts, ka oportūnistiskā patogēna Mycobacterium avium (M. avium) genotipi ir ārkārtīgi stabili vidē. Šie secinājumi ir izdarīti no MIRU-VNTR genotipēšanas – metodes, kuru salīdzinoši stipri ietekmē homoplāzijas efekti. Tomēr vēl jorojām MIRU-VNTR neaizstājama metode daudzu lēni augošu un monomorfisku mikroorganismu pētījumos. Kaut arī līdz šim nekad nav veikta izvērsta homoplāzijas efektu ietekme uz tuvradniecīgām MIRU-VNTR genotipu populācijām, šis rādītājs var būtiski ietekmēt genotipēšanas rezultātu interpretāciju. Šajā darbā ar IS 1245 RFLP un MIRU-VNTR genotipēšanu ir izpētīta MAC izolātu ģenētiskā daudzveidība starp 43 cūkās un cilvēkos izolētiem paraugiem, salīdzināta genotipu izplatība starp abām izolātu grupām un novērtēta iespēja Latvijā ieviest epidemioloģisku izsekošanu slimniekiem ar konstatētu MAC infekciju. Tāpat šajā darbā ir novērtēta MIRU-VNTR homoplāzijas saistība ar filoģenētiskās radniecības pakāpi, izmantojot teorētisko klonālās ekspansijas modeli, kas imitē M. avium MIRU-VNTR genotipu evolūciju. Šī pētījuma rezultāti liecina, ka pastāv augsta M. avium genotipu līdzības pakāpe starp laikā un telpā nodalītiem izolātiem, liecinot par iespējamu kopīgu infekcijas avotu. Klonālās ekspansijas simulācijās ir novērots, ka pastāv oscilācijas starp filoģenētiski tuvradniecīgiem genotipiem, kas ir jāņem vērā rezultātu interpretēšanā. Teorētisko rezultātu ticamību apstiprina arī sistemātiski analizēti literatūras dati un Latvijā iegūto eksperimentalo izolātu dati. Nākotnē ir jāievieš epidemioloģiskā informācija par pacientiem ar MAC infekcijām un jāveic genotipēšana pēc papildus marķieriem, lai noteiktu iespējamo infekcijas avotu plaušu slimību pacientu vidū gan starp cilvēkiem, gan starp cūku fermām. Šī pētījuma teorētiskie rezultāti ir jāņem vērā, interpretējot MIRU-VNTR genotipēšanas datus ne tikai globālu datu analīzē, bet arī ģeogrāfiski un laikā ierobežotos pētījumos.