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RESEARCH PRODUCT

Atlas Français des bactéries du sol

Battle KarimiNicolas Chemidlin Prévost-bouréSamuel DequiedtSébastien TerratLionel Ranjard

subject

[SDV] Life Sciences [q-bio][SDE] Environmental SciencesSolMicrobiologie du sol[SDV]Life Sciences [q-bio][SDE]Environmental SciencesBactérie du sol[SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal BiologyCommunauté bacterienne[SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology[SDV.SA.SDS]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Soil study[SDV.SA.SDS] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Soil study

description

Battle Karimi est post-doctorante dans l’UMR Agroécologie à l’INRA de Dijon et s’intéresse à l’écologie des communautés microbiennes. Elle a intégré l’équipe de recherche Biocom en 2016 afin d’analyser l’ensemble des données environnementales et microbiologiques issues du RMQS (Réseau de Mesures de la Qualité des Sols) et de les valoriser sous la forme du présent ouvrage. Elle a participé à la rédaction et à la mise en forme de la majeure partie de l’atlas, et a coordonné son avancement au sein de l’équipe d’auteurs.Nicolas Chemidlin-Prévost Bouré est maître de conférences en biologie des sols à AgroSup Dijon et membre de l’UMR Agroécologie. Spécialisé en écologie des communautés microbiennes de sol, il s’intéresse particulièrement à la biogéographie des micro-organismes, c’est-à-dire à leur distribution dans l’espace et dans le temps en lien avec les facteurs de l’environnement.Samuel Dequiedt est ingénieur d’étude à l’INRA de Dijon dans l’UMR Agroécologie.Expert dans la gestion des données et les analyses statistiques, il intervient dans les projets portant sur l’écologie microbienne à grande échelle (RMQS, paysages agricoles, etc.). Travaillant en collaboration avec les agriculteurs et les professionnels, il a acquis une expertise dans le transfert et la vulgarisation des connaissances sur l’écologie des micro-organismes et les outils de diagnostic de la qualité des sols.Sébastien Terrat est maître de Conférences à l’université de Bourgogne-Franche-Comté et membre de l’UMR Agroécologie. Spécialisé en écologie microbienne du sol et en bio-informatique,Lionel Ranjard est directeur de recherche à l’INRA de Dijon dans l’UMR Agroécologie. Il est spécialiste en écologie microbienne du sol et a coordonné depuis 2006 différents projets (ANR, ADEME, France Génomique, Eu) qui ont permis de développer la thématique de biogéographie microbienne par l’application des outils de métagénomique du sol sur le RMQS. Il a coordonné la publication de l’ouvrage avec la maison d’éditions Biotope.; International audience; Les sols abritent des communautés vivantes qui dépassent nos capacités de perception, par leur taille microscopique, mais aussi par leur incroyable foisonnement?: un seul gramme de sol peut contenir plusieurs milliards de bactéries et plusieurs millions de champignons?! Dans ce même gramme de sol, on peut distinguer entre 100?000 et un million d'espèces de bactéries... Rien dans notre environnement quotidien, si ce n'est un ciel étoilé, ne nous prépare à une pareille abondance et une telle diversité. Les chercheurs spécialistes de l'écologie microbienne de l'unité mixte de recherche " Agroécologie ", rattachée à l'INRA Bourgogne-Franche-Comté, ont réalisé un inventaire des communautés bactériennes des sols de France. Basé sur les techniques les plus en pointe de séquençage d'ADN, ce travail a débouché sur la réalisation de cet atlas qui nous offre un panorama de ces communautés bactériennes, nous sensibilisant à leur importance dans la qualité et la fertilité des sols. Un ouvrage unique tant par le sujet traité, que par des représentations originales qui nous permettent d'appréhender le monde bactérien des sols.

https://hal-agrosup-dijon.archives-ouvertes.fr/hal-02067268