6533b83afe1ef96bd12a7362

RESEARCH PRODUCT

HCV vīrusa genomu CORE/ARFP reģiona sekvenču analīze

subject

description

C hepatīta vīruss (HCV) – pieder flavivīrusu dzimtai. HCV ir apvalku saturošs vīruss. HCV var izraisīt tikai cilvēka un augstāko primātu slimības. C hepatīta vīrusa (HCV) ierosināta infekcija ir pasaulē izplatīts iemesls hroniskām aknu slimībām. Pret HCV vēl nav izstrādāta vakcīna. HCV ir pirmais vīruss, kas ir atklāts ar molekulārās klonēšanas palīdzību, bez tiešas bioloģisko vai biofizikālo metožu palīdzības. Galvenā HCV vīrusa īpatnība ir izteikta ģenētiskā mainība. ARFP (alternatīvās nolasīšanas rāmja proteīns) jeb F (nobīdes), jeb core +1 proteīns (17 kDa) ir radies ribosomu -2/+1 nobīdes rezultātā N-gala core -kodēšanas reģionā HCV poliproteīnā. Joprojām nav zināma ARFP bioloģiskā funkcija. Darba mērķis ir apgūt molekulārās bioloģijas metodes. Noteikt optimālo annealing temperatūru PCR reakcijai core/ARFP reģionam atbilstošo HCV genoma fragmentu amplificēšanai. Veikt HCV core/ARFP reģiona amplifikāciju un sekvenešanu no HCV hronisko pacientu seruma. Veikt iegūto PCR produktu klonēšanu un sekvenēšanu. Analizēt iegūtās sekvences. Noteikt a-ARFP un a- core antivielu klātbūtni pacientu asins serumos.