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RESEARCH PRODUCT

Élaboration du premier référentiel territorial de la qualité microbiologique des sols afin de promouvoir la transition agroécologique

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National audience; Le sujet de thèse fait partie d’un projet de développement territorial, porté par Dijon Métropole,dont l’objectif est de développer un système alimentaire durable d’ici 2030 sur l’aire urbainede Dijon Métropole (3000 km2). Il s’inscrit dans l’une des actions du projet : l’action Sol Expertdont l’objectif est de développer un référentiel territorial de la qualité des sols afin de validerun diagnostic opérationnel pour accompagner la transition agroécologique. La question derecherche du sujet de thèse porte sur l’étude de l’effet des modes d’usage et des pratiquesassociées sur les communautés microbiennes telluriques et les services qu’elles fournissent.Des objectifs fondamentaux portant sur l’amélioration des connaissances en écologie descommunautés microbiennes des sols découlent de cette question de recherche. Des objectifsplus finalisés consistent à valider un diagnostic opérationnel de la qualité microbiologique dessols à l’échelle d’un territoire et appropriable par les usagers des sols. Une stratégied’échantillonnage pour 600 sites a été développée afin de capter l’hétérogénéité de l’ensembledu territoire (zones urbaine, péri-urbaine et rurale). Le travail expérimental de la thèse consisteà utiliser des outils de biologie moléculaire pour obtenir deux indicateurs microbienscaractéristiques de la qualité biologique du sol, la biomasse moléculaire microbienne et ladiversité des communautés de bactéries et de champignons. L’approche de biogéographiedéployée à l’échelle du territoire de Dijon Métropole va permettre i) d’une part de mieuxcomprendre les processus écologiques déterminant les profils de distribution spatiale et larégulation des communautés microbiennes, et ii) d’autre part de fournir le premier référentielterritorial de la qualité microbiologique des sols.