6533b85efe1ef96bd12bf75e

RESEARCH PRODUCT

Datu analīzes algoritma izstrāde šūnas kodolā internalizējošu aptamēru atlasei

Rūdolfs Strazdīts

subject

šūnu kodolsDNSdatu apstrādeFarmācijaaptamēriinternalizētas sekvences

description

Aptamēri ir moderna zāļu ārstēšanās forma ar lielu potenciālu, kas iekļauj sevī gan jaunas diagnostikas iespējas, tā var tikt lietota kā zāļu forma kurai piemīt agonisma vai antagonisma farmakoloģiskās īpašības pret receptoriem, vai aptamēri var tikt izmantoti kā īpašs zāļu transports. Aptamēru iegūšanas un pētīšanas metodika ir ļoti daudzveidīga un vēl aizvien uzlabojama, jo tai ir daudz posmu, kurus ir iespējams modificēt un pielāgot izpētes vajadzībām, īpaši interesanta ir arī sekvenču datu apstrādes daļa, caur kuru no miljoniem sekvenču beigās, pēc aptamēriem nepieciešamām īpašībām – specifiskuma pret mērķi, saistīšanās spējas jeb afinitātes ar mērķi, oligonukleotīdu stabilitātes un citām īpašībām, tās tiek atlasītas un tikai tad tās var tikt sauktas par aptamēriem. Šajā bakalaura darbā mēs vēlējāmies padziļināti izpētīt un apskatīt datu apstrādes iespējas, lai beigās panāktu atkārtojamu rezultātu, ja tiktu izmantoti līdzīgi dati, šajā gadījumā no pētītām sekvencēm, kuras spētu internalizēties šūnas kodolā.

https://dspace.lu.lv/dspace/handle/7/51289