6533b860fe1ef96bd12c3de0

RESEARCH PRODUCT

Investigation of inhibitors for the SARS-CoV-2 methyltransferase nsp14

subject

description

SARS-CoV-2 parādījās 2019. gada nogalē un ātri vien kļuva par nopietnu draudu sabiedrības veselībai, radot vajadzību pēc terapeitiskiem līdzekļiem tā izraisītās slimības Covid-19 ārstēšanai. Viens variants ir radīt potentu inhibitoru pret kādu no proteīniem, kas nepieciešams vīrusa dzīves cikla īstenošanai. Potenciāls mērķis ir nestrukturālais proteīns 14 (nsp14), kura metiltransferāzes aktivitāte svarīga vīrusa mRNS stabilitātei un translācijai. Darba mērķis bija iegūt aktīvu SARS-CoV-2 nsp14/nsp10 kompleksu un, veicot KMR fragmentu skrīningu, meklēt savienojumus, kas saistās tā metiltransferāzes aktīvajā centrā (S- adenozil-L-metionīna (SAM) saistīšanas kabatā). Pētījuma ietvaros E. coli ekspresijas sistēmā tika producēti nsp14 un nsp10 proteīni un tika veikts nsp14/nsp10 kompleksa KMR skrīnings 695 fragmentu bibliotēkai. No 47 savienojumiem, kas KMR eksperimentos uzrādīja saistību, divi konkurēja ar SAM analogu sinefungīnu, norādot uz to, ka ir spējīgi saistīties metiltransferāzes aktīvajā centrā. Bakalaura darbs tika izstrādāts Latvijas Organiskās sintēzes institūtā, Valsts pētījumu programmas (VPP) “Covid-19 seku mazināšanai” projekta “Jaunu terapeitisko un profilaktisko līdzekļu izstrāde pret Covid-19 un koronavīrusiem” ietvaros.