Search results for "Bio-informatique"
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Apport des nouvelles générations de séquençage pour accéder à la diversité des communautés microbiennes du sol : nécessité d’un ‘pipeline’ bio-inform…
2011
Communication orale, résuméCommunication orale, résumé; La diversité microbienne d’un sol est difficile à caractériser. Ceci s’explique par une accessibilité plus ou moins importante des populations au sein d’une matrice hétérogène et structurée, mais aussi par l’incapacité à résoudre une information constituée de 100 000 à 1 000 000 d’espèces différentes par gramme de sol. Toutefois, récemment, d’importantes avancées en biologie moléculaire ont permis de mieux caractériser la diversité des communautés microbiennes du sol in situ et ce sans a priori. Ainsi, la puissance des nouvelles générations de séquençage comme le pyroséquençage permettent de travailler en haut-débit afin d’obtenir plus…
Etudes d'objets combinatoires : applications à la bio-informatique
2011
This thesis considers classes of combinatorial objects that model data in bioinformatics. We have studied two methods of mutation of genes within the genome : duplication and inversion. At first,we study the problem of the whole mirror duplication-random lossmodel in terms of pattern avoiding permutations. We prove that the class of permutations obtained with this method after p duplications from the identity is the class of permutations avoiding alternating permutations of length 2p + 1.We also enumerate the number of duplications that are necessary and sufficient to obtain any permutation of length n from the identity. We also suggest two efficient algorithms to reconstruct two different …
Apport des nouvelles générations de séquençage pour accéder à la diversité des communautés microbiennes du sol : nécessité d’un ‘pipeline’ bio-inform…
2012
National audience
CYGD: the Comprehensive Yeast Genome Database.
2005
The comprehensive resource is available under http://mips.gsf.de/genre/proj/yeast/.; International audience; The Comprehensive Yeast Genome Database (CYGD) compiles a comprehensive data resource for information on the cellular functions of the yeast Saccharomyces cerevisiae and related species, chosen as the best understood model organism for eukaryotes. The database serves as a common resource generated by a European consortium, going beyond the provision of sequence information and functional annotations on individual genes and proteins. In addition, it provides information on the physical and functional interactions among proteins as well as other genetic elements. These cellular network…