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Estudio de la diseminación de elementos genéticos móviles en la microbiota intestinal
2021
La multirresistencia a antibióticos en patógenos bacterianos, incluyendo enterobacterias y enterococo, está catalogada por la OMS como uno de los 3 principales problemas de salud a nivel mundial del siglo XXI. La adquisición de nuevas resistencias está altamente relacionada con la diseminación de plásmidos conjugativos y otros elementos genéticos móviles (EGM) que codifican genes que confieren resistencia a antibióticos. Las características específicas del ambiente intestinal, entre las que destaca la elevada densidad bacteriana que permite el contacto directo entre bacterias filogenéticamente alejadas, convierten al intestino en un nicho muy favorable para la diseminación de EGM y por tant…
Understanding the dialog between the gut microbiota and the endosymbiont in the model system Blattella germanica
2020
Aquesta tesi doctoral forma part de la investigació sobre l’evolució de la simbiosi en insectes realitzada durant molts anys pel grup de Genètica Evolutiva de la Universitat de València. L’organisme model utilitzat en aquest estudi és la panerola alemanya, Blattella germanica, un insecte omnívor i cosmopolita. La panerola alemanya posseeix dos simbionts: un endosimbiont, Blattabacterium, i una microbiota intestinal complexa. La funció de l’endosimbiont ha estat proposada prèviament com a la producció de metabòlits essencials mitjançant el reciclatge del nitrogen a través de la via ureolítica. Aquesta panerola comparteix la font d’aliment i l’ambient amb els humans, cosa que podria explicar …
Fraccionando la microbiota gastrointestinal humana
2012
La microbiota gastrointestinal humana es una de las comunidades microbianas más diversa y compleja que se puede encontrar en la naturaleza. Las nuevas tecnologías de secuenciación permiten obtener una amplia visión de la diversidad microbiana, lo que ha revelado una gran cantidad de bacterias no cultivables. A pesar del potencial de estas tecnologías de alto rendimiento la metagenómica no muestra la imagen completa. La citometría de flujo es una metodología que permite describir y/o separar fracciones de comunidades microbianas basándose en características como el DNA, RNA o proteínas, así como de la misma taxonomía microbiana. La citometría de flujo y la separación de células junto con las…
Soluciones bioinformáticas para el análisis de datos ómicos, descubrimiento de conocimiento y diagnóstico genético en Sparus aurata y otros organismo…
2023
Esta tesis ha sido financiada por el Ministerio de Ciencia e Innovación a través de la ayuda “DI-17-09134” para contratos para la formación de doctores en empresas (Doctorados Industriales). Con el incremento de datos generados mediante el uso de las tecnologías de secuenciación, es necesario el diseño de protocolos y herramientas que permitan el análisis y la integración de los mismos con el objetivo de entender y comprender los sistemas biológicos que forman parte de cada estudio en particular. Estas herramientas, además, es preferible que sean intuitivas y de fácil manejo para los usuarios, de manera que puedan ser utilizadas por cualquier investigador y no solamente por aquellos que sea…
¿Pueden los probióticos modificar las complicaciones asociadas a la obesidad infantil?
2022
En los últimos años, la microbiota intestinal se ha convertido en una novedosa y prometedora diana terapéutica para el tratamiento de la obesidad y enfermedades asociadas. Nuestra cepa de estudio, Bifidobacterium pseudocatenulatum CECT 7765, ha demostrado en repetidos estudios con modelos animales de obesidad que mejora alteraciones metabólicas e inmunológicas y restaura el daño vascular. HIPÓTESIS Y OBJETIVOS Según nuestra hipótesis, los resultados obtenidos en modelos murinos podrían ser reproducibles en humanos con el consumo regular de B. pseudocatenulatum CECT 7765, junto con la adopción de hábitos de alimentación saludables. El presente estudio clínico tiene como objetivo evaluar los …
Microbiota intestinal, ¿nuevo biomarcador en cáncer de pulmón no microcítico?
2021
El cáncer de pulmón es el tumor con mayor mortalidad a nivel mundial y, el cáncer de pulmón no microcítico representa el 85% de casos de cáncer de pulmón. El intestino humano alberga una comunidad microbiana compleja, conocida como microbiota intestinal. En los últimos años, la microbiota intestinal es considerada como un “nuevo órgano” del cuerpo humano, mostrando un papel importante tanto en el metabolismo como en la modulación del sistema inmunitario del individuo. Estudios recientes demuestran que la microbiota intestinal puede tener un impacto en la respuesta inmune antitumoral. El objetivo principal de este trabajo de tesis doctoral es caracterizar de forma exhaustiva la microbiota in…
Eficacia y mecanismos de acción de bacterias intestinales en alteraciones metabólicas e inmunológicas asociadas a la obesidad y al estrés
2015
El objetivo general de la presente Tesis ha sido analizar la contribución de la microbiota intestinal a la función del sistema inmune, metabolismo, Sistema Nervioso Central y evaluar el efecto de potenciales probióticos en modelos animales de obesidad y ansiedad inducida por estrés. Los objetivos concretos han sido los siguientes: 1. Evaluar la eficacia de Bacteroides uniformis CECT 7771 en un modelo murino de obesidad inducida por la dieta. 2. Identificar el mecanismo de acción de la cepa Bifidobacterium pseudocatenulatum CECT 7765 sobre el metabolismo lipídico y el de la glucosa en hígado mediante el análisis de expresión génica global y proteínas en un modelo murino de obesidad inducida …
Ievads vispārējā bioloģijā
1926
No angļu valodas tulkojis Egons Dārziņš
Replication of Human Norovirus in Mice after Antibiotic-Mediated Intestinal Bacteria Depletion
2022
Human noroviruses (HuNoVs) are the main cause of acute gastroenteritis causing more than 50,000 deaths per year. Recent evidence shows that the gut microbiota plays a key role in enteric virus infectivity. In this context, we tested whether microbiota depletion or microbiota replacement with that of human individuals susceptible to HuNoVs infection could favor viral replication in mice. Four groups of mice (n = 5) were used, including a control group and three groups that were treated with antibiotics to eliminate the autochthonous intestinal microbiota. Two of the antibiotic-treated groups received fecal microbiota transplantation from a pool of feces from infants (age 1-3 months) or an au…
Comprehensive dataset of shotgun metagenomes from oxygen stratified freshwater lakes and ponds
2021
Stratified lakes and ponds featuring steep oxygen gradients are significant net sources of greenhouse gases and hotspots in the carbon cycle. Despite their significant biogeochemical roles, the microbial communities, especially in the oxygen depleted compartments, are poorly known. Here, we present a comprehensive dataset including 267 shotgun metagenomes from 41 stratified lakes and ponds mainly located in the boreal and subarctic regions, but also including one tropical reservoir and one temperate lake. For most lakes and ponds, the data includes a vertical sample set spanning from the oxic surface to the anoxic bottom layer. The majority of the samples were collected during the open wate…