Search results for "DARP"
showing 3 items of 3 documents
A Library-Based Screening Strategy for the Identification of DARPins as Ligands for Receptor-Targeted AAV and Lentiviral Vectors
2021
Delivering genes selectively to the therapeutically relevant cell type is among the prime goals of vector development. Here, we present a high-throughput selection and screening process that identifies designed ankyrin repeat proteins (DARPins) optimally suited for receptor-targeted gene delivery using adeno-associated viral (AAV) and lentiviral (LV) vectors. In particular, the process includes expression, purification, and in situ biotinylation of the extracellular domains of target receptors as Fc fusion proteins in mammalian cells and the selection of high-affinity binders by ribosome display from DARPin libraries each covering more than 1012 variants. This way, DARPins specific for the …
G-quadruplex recognition by DARPIns through epitope/paratope analogy
2022
AbstractWe investigated the mechanisms leading to the specific recognition of Guanine Guadruplex (G4) by DARPins peptides, which can lead to the design of G4s specific sensors. To this end we carried out all-atom molecular dynamic simulations to unravel the interactions between specific nucleic acids, including human-telomeric (h-telo), Bcl-2, and c-Myc, with different peptides, forming a DARPin/G4 complex. By comparing the sequences of DARPin with that of a peptide known for its high affinity for c-Myc, we show that the recognition cannot be ascribed to sequence similarity but, instead, depends on the complementarity between the three-dimensional arrangement of the molecular fragments invo…
MARP - proteiiniperheen proteiinien mRNA –määrät venymis - lyhenemissykli -tyyppisen kuormituksen jälkeen
2010
Riina Flink. 2010. MARP – proteiiniperheen proteiinien mRNA – määrät venymis – lyhenemissykli – tyyppisen – kuormituksen jälkeen. Kandidaatin tutkielma, Liikuntafysiologia. Liikuntabiologian laitos, Jyväskylän yliopisto. 37s. MARP (muscle ankyrin repeat protein) – proteiiniperheen proteiinien arvellaan olevan mukana etenkin luurankolihaksen adaptoitumisessa paljon eksentristä lihasliikettä sisältävään harjoitukseen. Arvellaan, että ne saattavat ehkäistä muun muassa soluvaurioilta. Niiden ilmenemistä fyysisen rasituksen yhteydessä on kuitenkin tutkittu ihmisillä vasta yhdessä tutkimuksessa (Lehti ym .2009) ja tietoa tarvitaan lisää. Tämän tutkimuksen tarkoituksena olikin tutkia, miten CARP:i…