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Metaproteomics: a new approach for studying functional microbial ecology

2008

Establishing the link between microbial diversity and ecosystem functioning constitutes one of the fundamental questions in microbial ecology. However, microbial biodiversity cannot be resolved in a single manner and the question arises about which of the genetic and/or taxonomic and/or functional components of biodiversity are the most relevant in such a problematic. To date, most researches in this field has focused on genetic diversity and few investigations have examined functional diversity, resulting in a poor understanding of the manner in which genetic and taxonomic diversity affect functional diversity or ecosystem properties. This can be explained by paucity of methods allowing an…

Dynamique des intéractions plante-microorganismes dans la rhizosphère: vers une meilleure prise en compte du fonctionnement de la plante et conséquen…

2010

La diversité des communautés végétales des forêts alluviales de l’Allier est-elle affectée par l’invasion de l’Érable négundo, du Robinier faux-acaci…

2012

Identifiant ProdInra 270418 SPE EcolDur CT3; Master; L’objectif de notre étude a été d’analyser les effets de l’invasion de 3 espèces végétales (Érable négundo, Robinier faux-acacia, Renouée de Bohême) sur la diversité spécifique et fonctionnelle ainsi que sur la structure et la composition spécifique des communautés végétales des forêts alluviales de l’Allier. Des relevés de végétation ont été réalisés dans des paires de quadrats contiguës, envahis et non envahis par les 3 espèces invasives étudiées et dans 3 habitats envahis des forêts alluviales de l’Allier (Saulaie-peupleraie de niveau topographique haut et bas et Chênaie pédonculée-ormaie). Complémentairement à cette approche, un gradi…

Maîtrise et gestion de la biodiversité dans les sols: quelles perspectives ?

2012

National audience

Colonisation des paysages agricoles par les espèces des bordures adjacentes : apports de l’approche fonctionnelle

2014

National audience; Une crainte avancée par les agriculteurs repose sur l’hypothèse qu’une gestion plus raisonnée des bordures adjacentes aux champs cultivés pourrait, par relâchement de la pression de fauche, favoriser l’entrée de nouvelles espèces, bisannuelles ou pérennes, dans les parcelles agricoles. Afin de répondre à cette interrogation, notre objectif a été de proposer un cadre conceptuel théorique associant plusieurs champs disciplinaires de l’écologie. En comparaison des études précédemment réalisées, notre apport réside en la prise en compte des traits fonctionnels favorisant la dispersion à courte et longue distance, ainsi que des traits expliquant le maintien de populations viab…

Suivi de biofilms monospécifiques et plurispécifiques de Candida sp. sur plaque d'acier inoxydable en fonction du temps de développement et de la tem…

2009

Loss in microbial diversity affects nitrogen cycling in soil

2013

National audience; Microbial communities have a central role in ecosystem processes by driving the Earth’s biogeochemical cycles. However, the importance of microbial diversity for ecosystem functioning is still debated. Here, we experimentally manipulated the soil microbial community using a dilution approach to analyze the functional consequences of diversity loss. A trait-centered approach was embraced using the denitrifiers as model guild due to their role in nitrogen cycling, a major ecosystem service. How various diversity metrics related to richness, eveness and phylogenetic diversity of the soil denitrifier community were affected by the removal experiment was assessed by 454 sequen…

Connectivité d’un paysage agricole et processus de dispersion des adventices. Approche par l’analyse de la similarité des communautés

2013

Rapport de Stage de Master 2 Sciences, Technologies et Santé (STS) SPE ECOLDUR équipe CAPA; Master; Comprendre la connectivité fonctionnelle d’un paysage pour une espèce ou un groupe d’espèces donné revient à rechercher des distances écologiques pertinentes vis-à-vis de la dispersion de ces organismes. Pour cela, la similarité dans la composition en espèce entre communautés, qui mesure leur degré de ressemblance, peut être mise en relation avec des distances écologiques entre ces communautés qui sont issues de mesures de connectivité du paysage, et qui reposent sur des hypothèses concernant les processus de dispersion. Au sujet des adventices des cultures, une hypothèse est que la prise en …

EcoFINDERS, Ecological Function and Biodiversity Indicators in European Soils

2012

Distribution spatiale et traduction fonctionnelle de la diversité microbienne des sols

2013

Le sol, après avoir longtemps été considéré comme un support de construction et de production, est maintenant légitimé comme un des derniers remparts pour la biodiversité terrestre. Parmi les organismes indigènes du sol, les microorganismes et notamment les bactéries sont les plus abondants et diversifiés avec plusieurs milliards d’individus représentant plusieurs millions d’espèces différentes par gramme de sol. De plus, ces microorganismes ont un rôle dans les cycles biogéochimiques des éléments majeurs (C, N, P…) et donc dans les services écosystèmiques que peut rendre le sol (recyclage éléments minéraux, qualité de l’atmosphère et de l’eau, production primaire…). Par conséquent, afin d’…