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Helicobacter pylori gamma-glutamyl transpeptidase and vacuolating cytotoxin promote gastric persistence and immune tolerance
2013
Infection with the gastric bacterial pathogen Helicobacter pylori is typically contracted in early childhood and often persists for decades. The immunomodulatory properties of H. pylori that allow it to colonize humans persistently are believed to also account for H. pylori ’s protective effects against allergic and chronic inflammatory diseases. H. pylori infection efficiently reprograms dendritic cells (DCs) toward a tolerogenic phenotype and induces regulatory T cells (Tregs) with highly suppressive activity in models of allergen-induced asthma. We show here that two H. pylori virulence determinants, the γ-glutamyl transpeptidase GGT and the vacuolating cytotoxin VacA, contribute critic…
Highlights on two decades with microbiota and inflammatory bowel disease from etiology to therapy
2023
Inflammatory Bowel diseases (IBDs) constitute a complex panel of disorders characterized with chronic inflammation affecting the alimentary canal along with extra intestinal manifestations. Its exact etiology is still unknown; however, it seems to be the result of uncharacterized environmental insults in the intestine and their immunological consequences along with dysbiosis, in genetically predisposed individuals. It was the main target of our team since 2002 to explore the etiology of IBD and the related role of bacteria. For almost two decades, our laboratory, among others, has been involved in the reciprocal interaction between the host gastrointestinal lining and the homing microbiota.…
Suppression of intestinal microbiota-dependent production of pro-atherogenic trimethylamine N-oxide by shifting L-carnitine microbial degradation.
2014
Abstract Aims Trimethylamine-N-oxide (TMAO) is produced in host liver from trimethylamine (TMA). TMAO and TMA share common dietary quaternary amine precursors, carnitine and choline, which are metabolized by the intestinal microbiota. TMAO recently has been linked to the pathogenesis of atherosclerosis and severity of cardiovascular diseases. We examined the effects of anti-atherosclerotic compound meldonium, an aza-analogue of carnitine bioprecursor gamma-butyrobetaine (GBB), on the availability of TMA and TMAO. Main methods Wistar rats received L-carnitine, GBB or choline alone or in combination with meldonium. Plasma, urine and rat small intestine perfusate samples were assayed for L-car…
Extremophilic taxa predominate in a microbial community of photovoltaic panels in a tropical region
2021
ABSTRACT Photovoltaic panels can be colonized by a highly diverse microbial diversity, despite life-threatening conditions. Although they are distributed worldwide, the microorganisms living on their surfaces have never been profiled in tropical regions using 16S rRNA high-throughput sequencing and PICRUst metagenome prediction of functional content. In this work, we investigated photovoltaic panels from two cities in southeast Brazil, Sorocaba and Itatiba, using these bioinformatics approach. Results showed that, despite significant differences in microbial diversity (p < 0.001), the taxonomic profile was very similar for both photovoltaic panels, dominated mainly by Proteobacteria,…
Yeast biota of naturally fermented black olives in different brines made from cv. Gemlik grown in various districts of the Cukurova region of Turkey.
2015
In this study, the yeast microbiota of naturally fermented black olives made from cv. Gemlik, grown in three different districts of the Cukurova region of Turkey, were investigated. Fermentations were conducted for 180days in three different brines, including NaCl 10% w/v, NaCl 8% w/v and NaCl 8% w/v added with glucose 0.5%. In total, 223 yeasts were isolated and then identified by PCR-RFLP analysis of the 5.8S ITS rRNA region and sequence information for the D1/D2 domains of the 26S rRNA gene. A broad range of yeast biodiversity was identified, including eight genera and nine species. Candida boidinii (41%), Wickerhamomyces anomalus (32%) and Saccharomyces sp. (18%) were predominant yeasts…
Estudio de la diseminación de elementos genéticos móviles en la microbiota intestinal
2021
La multirresistencia a antibióticos en patógenos bacterianos, incluyendo enterobacterias y enterococo, está catalogada por la OMS como uno de los 3 principales problemas de salud a nivel mundial del siglo XXI. La adquisición de nuevas resistencias está altamente relacionada con la diseminación de plásmidos conjugativos y otros elementos genéticos móviles (EGM) que codifican genes que confieren resistencia a antibióticos. Las características específicas del ambiente intestinal, entre las que destaca la elevada densidad bacteriana que permite el contacto directo entre bacterias filogenéticamente alejadas, convierten al intestino en un nicho muy favorable para la diseminación de EGM y por tant…
Understanding the dialog between the gut microbiota and the endosymbiont in the model system Blattella germanica
2020
Aquesta tesi doctoral forma part de la investigació sobre l’evolució de la simbiosi en insectes realitzada durant molts anys pel grup de Genètica Evolutiva de la Universitat de València. L’organisme model utilitzat en aquest estudi és la panerola alemanya, Blattella germanica, un insecte omnívor i cosmopolita. La panerola alemanya posseeix dos simbionts: un endosimbiont, Blattabacterium, i una microbiota intestinal complexa. La funció de l’endosimbiont ha estat proposada prèviament com a la producció de metabòlits essencials mitjançant el reciclatge del nitrogen a través de la via ureolítica. Aquesta panerola comparteix la font d’aliment i l’ambient amb els humans, cosa que podria explicar …
Fraccionando la microbiota gastrointestinal humana
2012
La microbiota gastrointestinal humana es una de las comunidades microbianas más diversa y compleja que se puede encontrar en la naturaleza. Las nuevas tecnologías de secuenciación permiten obtener una amplia visión de la diversidad microbiana, lo que ha revelado una gran cantidad de bacterias no cultivables. A pesar del potencial de estas tecnologías de alto rendimiento la metagenómica no muestra la imagen completa. La citometría de flujo es una metodología que permite describir y/o separar fracciones de comunidades microbianas basándose en características como el DNA, RNA o proteínas, así como de la misma taxonomía microbiana. La citometría de flujo y la separación de células junto con las…
Soluciones bioinformáticas para el análisis de datos ómicos, descubrimiento de conocimiento y diagnóstico genético en Sparus aurata y otros organismo…
2023
Esta tesis ha sido financiada por el Ministerio de Ciencia e Innovación a través de la ayuda “DI-17-09134” para contratos para la formación de doctores en empresas (Doctorados Industriales). Con el incremento de datos generados mediante el uso de las tecnologías de secuenciación, es necesario el diseño de protocolos y herramientas que permitan el análisis y la integración de los mismos con el objetivo de entender y comprender los sistemas biológicos que forman parte de cada estudio en particular. Estas herramientas, además, es preferible que sean intuitivas y de fácil manejo para los usuarios, de manera que puedan ser utilizadas por cualquier investigador y no solamente por aquellos que sea…
¿Pueden los probióticos modificar las complicaciones asociadas a la obesidad infantil?
2022
En los últimos años, la microbiota intestinal se ha convertido en una novedosa y prometedora diana terapéutica para el tratamiento de la obesidad y enfermedades asociadas. Nuestra cepa de estudio, Bifidobacterium pseudocatenulatum CECT 7765, ha demostrado en repetidos estudios con modelos animales de obesidad que mejora alteraciones metabólicas e inmunológicas y restaura el daño vascular. HIPÓTESIS Y OBJETIVOS Según nuestra hipótesis, los resultados obtenidos en modelos murinos podrían ser reproducibles en humanos con el consumo regular de B. pseudocatenulatum CECT 7765, junto con la adopción de hábitos de alimentación saludables. El presente estudio clínico tiene como objetivo evaluar los …