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Étude de la biodégradation de l'herbicide acide 2.4-dichlorophénoxyacétique (2.4-D) dans des sols agricoles de la région de Constantine

2011

Les principaux facteurs conditionnant la biodégradation du 2,4-D dans trois sols agricoles algériens (45IB, 46BM et 47AA), notamment l'humidité et la température, ont été examinés. Les cinétiques de minéralisation de l'herbicide ont été déterminées par radiorespirométrie, qui consiste à piéger et estimer le 14C02 formé dans une solution de soude à l'aide d'un compteur à scintillation liquide. Les résultats obtenus confirment la présence de microorganismes dégradants le 2,4-D et la biodégradation de cet herbicide semble dépendre essentiellement des propriétés physicochimiques intrinsèques des sols notamment la teneur en argile et MgO. Le sol 46BM, caractérisé par de faibles quantités en sabl…

Quantification of denitrifiers by real-time PCR

2007

Comparaison de deux témoins d’inhibition de la PCR diagnostique

2015

National audience

Résistance du coquelicot aux inhibiteurs de l'ALS: La mise au point d'outils de diagnostic rapide a permis de révéler la présence de cette résistance…

2011

National audience; Les inhibiteurs de l'acétolactate-synthase (ALS) sont actuellement la principale famille d'herbicides utilisés en France. La capacité de diagnostiquer rapidement la présence de plantes résistantes dans les parcelles contribue au maintien de leur efficacité. Des tests « ADN » ont été développés chez les coquelicots (Papaver rhoeas, Papaver dubium et Papaver argemone) pour détecter les mutations de l'ALS conférant une résistance à des herbicides. Les tests ont servi à analyser des plantes de coquelicots provenant de parcelles où des échecs de contrôle par des inhibiteurs de l'ALS ont été observés. Ils ont révélé la présence de mutations de l'ALS en fréquences élevées dans 2…

Technosols to reclaim industrial wastelands: depth distribution of abundance and activity of N-cycling microbial communities

2012

International audience; Construction of Technosols through assemblage of treated soil and recycled wastes is an innovative option for the restoration of degraded lands and re-use of industrial wastes. Recent studies have evidenced that Technosols could support soil functions such as primary production but the knowledge about other ecosystemic services, such as nutrient cycling, is limited. In this work, we investigated the abundance and the activity of microbial communities involved in N-cycling in different horizons (0–15, 15–35, 35–70 cm) of two types of Technosols constructed to reclaim an industrial wasteland. The estimation by real-time PCR of the abundances of the different microbial …

Species-specific prey choice of carabid beetles in European cereal fields

2017

National audience; Trophic interactions between species in agroecosystems provide key regulation ecosystem services and therefore also determine the dynamics, robustness and resilience of service provision. To achieve international goals of reducing application of pesticides without compromising key provisioning ecosystem services such as crop yield, recent research attaches importance to the biological control potential of carabid beetles. However, apart from feeding on pest species and weed seeds, carabids also consume non-pest prey (alternative prey) such as collembolans and earthworms, which can play a contradictory role in the efficacy of pest and weed control. Most carabids are descri…

Qualité du Sol - Méthode pour extraire directement l'ADN d'échantillons de sol (Norme française - internationale)

2012

La présente Norme internationale spécifie une méthode pour extraire directement l'ADN d'échantillons de sol en vue d'analyser la structure globale et l'abondance des communautés microbiennes du sol en utilisant des techniques de PCR. Cette méthode est principalement destinée aux sols agricoles et forestiers. Cette méthode peut ne pas être appropriée aux sols riches en matières organiques (par exemple sols de tourbières) ou aux sols très pollués par des polluants organiques ou des métaux lourds. L'extraction directe de l'ADN d'échantillons de sol fournit des informations précieuses sur l'abondance et la structure des communautés microbiennes qui sont des paramètres clés pour estimer la biodi…

Use of fonctional genes to quantify denitrifiers in the environment

2006

 ; During the last decade, application of molecular methods using cultivation-independent approaches has provided new insights into the composition and structure of denitrifying communities in various environments. However, little is known about their abundance, and quantification is still performed using cultivation-based approaches, which are not only biased by the inability to cultivate of many micro-organisms but also fastidious and time-consuming. Two types of cultivation-independent approaches have recently been developed to quantify denitrifiers. The first type, which is based on the hybridization technique, comprises the use of Southern hybridization and DNA arrays. The second type,…

Etude de la stabilité de l'ADN suivant différentes modalités de conservation

2014

Rapport de stage BTS EA (Plateforme et VN) GenoSol; DEUG

Responses of soil bacterial and fungal communities to extreme soil drought and rewetting

2013

Question: The patterns of resource allocation and activity of the soil microbial community over the dry summer in Mediterranean grasslands are still largely unknown. The microbial response to summer desiccation reflects adaptation strategies, setting the stage for a large rainfall-induced soil CO2 pulse upon rewetting, an important component of the ecosystem carbon budget. Methods: In three California annual grasslands, the present (DNA-based) and potentially active (RNA-based) soil bacterial and fungal communities were tracked over a summer season and in response to controlled rewetting of intact soil cores. Phylogenetic marker genes for bacterial (16S) and fungal (28S) RNA and DNA were se…