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Dynamique des antibiotiques et des antibiorésistances dans les agrosystèmes : Réponse écotoxicologique et adaptation des communautés microbiennes ter…

2019

National audience; La contamination environnementale par les antibiotiques favorise la dispersion de bactéries antibiorésistantes, ainsi que le développement de bactéries dégradantes pouvant les utiliser pour leur croissance. Propices pour réduire la contamination environnementale et donc la dispersion de l’antibiorésistance, elles représentent toutefois un danger potentiel envers l’efficacité des antibiotiques avec l’éventualité de transmissions de leur capacité aux microorganismes pathogènes. Ainsi, ma thèse a pour but d’explorer les scénarii de dispersion des capacités de résistance et de dégradation dans le contexte agricole de l’épandage de lisier porcin contaminé en antibiotique sulfa…

Les causes biologiques de la régression du bleuet (Centaurea cyanus L.)

2012

National audience; Dans les agroécosystèmes, un déclin de la diversité biologique causé par l’intensification des pratiques agricoles est actuellement observé. Parmi les espèces adventices, toutes ne répondent pas de la même façon à ces changements. Des traits biologiques spécifiques pourraient expliquer le déclin de certaines et la réussite d’autres. Ainsi, mieux comprendre les causes biologiques de la régression permettrait de mettre en place des stratégies de gestion dans ces systèmes agricoles intensifs. Le bleuet (Centaurea cyanus L.) est une messicole spécialiste de l’agroécosystème qui est actuellement en régression dans l’ouest de l’Europe . Cette espèce est par ailleurs considérée …

Evaluation ex ante des conséquences de l’adoption de la production intégrée à l’échelle de la Bourgogne

2014

Modéliser les couverts cultures : adventices pour étudier le rôle de la diversification des cultures dans les systèmes de culture agro écologiques

2019

National audience; La diversification des cultures est un levier majeur de gestion agroécologique des bioagresseurs. Ce papier illustre avec l'exemple de FLORSYS le rôle des modèles mécanistes de dynamique des adventices pour synthétiser les connaissances, les appliquer à la conception de systèmes de culture, et les transférer vers les acteurs. Des cas d'étude illustrent comment ce modèle sert à évaluer et promouvoir les bénéfices de la diversification des cultures en (1) identifiant les caractéristiques de cultures qui seraient idéales ("idéotypes") pour la gestion agroécologique des adventices, (2) traquant des stratégies de gestion basées sur la diversification des cultures dans des rése…

Évaluation par simulation des performances et de la durabilité de systèmes de culture innovants pour la gestion durable des adventices : exemple d’un…

2019

International audience; Les systèmes de culture d’un groupe DEPHY Ferme de l’Eure, majoritairement spécialisé en grande culture, ont été évalués avec le modèle de dynamique adventice FLORSYS. Les objectifs de ce groupe sont l’amélioration de la durabilité de leurs systèmes et le maintien ou la réduction de leur utilisation de produits phytosanitaires, dont les herbicides. L’évaluation porte sur une étape de l’innovation, en comparant le système de culture actuellement pratiqué aux systèmes innovants envisagés. Avec un indice de fréquence de traitement (IFT) herbicides moyen de 1,2 dans les systèmes de culture pratiqués, les systèmes innovants proposés par les agriculteurs permettent (à deux…

Loss in microbial diversity affects nitrogen cycling in soil

2013

National audience; Microbial communities have a central role in ecosystem processes by driving the Earth’s biogeochemical cycles. However, the importance of microbial diversity for ecosystem functioning is still debated. Here, we experimentally manipulated the soil microbial community using a dilution approach to analyze the functional consequences of diversity loss. A trait-centered approach was embraced using the denitrifiers as model guild due to their role in nitrogen cycling, a major ecosystem service. How various diversity metrics related to richness, eveness and phylogenetic diversity of the soil denitrifier community were affected by the removal experiment was assessed by 454 sequen…

Alomysys, un modèle simulant l’évolution de la flore adventice sous l’effet des pratiques agricoles

2012

Fiche n°13 - Filière Protéagineux EA EcolDur

Effet de la nutrition et du génotype sur les réponses de défense chez Medicago truncatula

2014

Les organismes phytopathogènes sont responsables de la destruction d’environ 30% des récoltes. Malgré leur impact négatif sur l’environnement et la santé humaine, les produits phytosanitaires restent un des principaux moyens de lutte. Dans un cadre général de diminution de l’utilisation de ces produits, mon projet de thèse a pour objectif de mieux comprendre l’effet de la nutrition de la plante et de son génotype sur les mécanismes moléculaires impliqués dans ses réponses de défense vis-à-vis des pathogènes et ceci afin de définir des stratégies de lutte innovantes. Etude de l’effet des carences nutritionnelle sur la signalisation cellulaire et moléculaire des réponses de défense par analys…

Peut-on, demain, produire sans herbicide

2017

National audience; Présentation et retour d’expérience des essais longue durée de l’INRA Dijon conduit sur le domaine d’Epoisses. Protection intégrée, systèmes innovants, leviers mis en oeuvre, évolution de la flore, impact économique … Ces pratiques sont-elles transposables dans les systèmes de la Haute-Marne et de l'Aube ? Échanges avec la salle.

Molecular studies of diversity of populations of arbuscular mycorrhizal fungi

2011

National audience; Arbuscular mycorrhiza fungi (AMF) which form a mutualistic symbiosis with most terrestrial plants are not only important for natural ecosystems, but also for agricultural production. The aim of this study is to characterize fungal populations at different geographic scales in order to better understand the processes influencing AMF taxonomic and functional diversity and to determine the environmental factors affecting AMF populations, especially in the context of agricultural management. The mitochondrial large subunit gene of ribosomal RNA will be used as molecular marker to resolve population structure of Rhizophagus irregularis (formerly known as Glomus intraradices). …