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Effets des interactions entre diversité végétale inter et intraspécifique et communautés microbiennes du sol sur les propriétés de l’écosystème - Can…
2019
National audience; Le lien entre diversité et fonctionnement d’un écosystème ainsi que les mécanismes sous-jacents sont très étudiés en génétique des populations et en écologie des communautés et des écosystèmes. La première s’attèle à décrire les effets de la variabilité génétique intraspécifique sur différentes propriétés écosystémiques tandis que la deuxième s’intéresse aux interactions écologiques au niveau interspécifique. Notre objectif est de faire le lien entre ces deux champs disciplinaires par l’étude des effets conjoints d’une mobilisation de la diversité végétale intra et interspécifique et de la diversité microbienne sur les propriétés de l’écosystème. Nous avons mesuré différe…
Caractérisation des communautés microbiennes des sols par des approches moléculaires - application au projet "Tahiti - relations multitrophiques"
2014
EA SPE GenoSol; DEUG
Caractérisation par stéréovision de l'hétérogénéité d'un peuplement adventice dans une culture
2007
National audience
Colonisation des paysages agricoles par les espèces des bordures adjacentes : apports de l’approche fonctionnelle
2014
National audience; Une crainte avancée par les agriculteurs repose sur l’hypothèse qu’une gestion plus raisonnée des bordures adjacentes aux champs cultivés pourrait, par relâchement de la pression de fauche, favoriser l’entrée de nouvelles espèces, bisannuelles ou pérennes, dans les parcelles agricoles. Afin de répondre à cette interrogation, notre objectif a été de proposer un cadre conceptuel théorique associant plusieurs champs disciplinaires de l’écologie. En comparaison des études précédemment réalisées, notre apport réside en la prise en compte des traits fonctionnels favorisant la dispersion à courte et longue distance, ainsi que des traits expliquant le maintien de populations viab…
Optimisation du pyroséquençage haut-débit pour caractériser la diversité taxonomique des communautés bactériennes des sols
2011
Affiche, résumé; International audience; La diversité microbienne d’un sol (que l’on estime entre 100 000 et 1 000 000 d’espèces différentes par gramme de sol) est difficile à caractériser. Toutefois, d’importantes avancées en biologie moléculaire, comme le développement du pyroséquençage, ont permis d'obtenir plusieurs centaines de milliers de séquences à partir d’un ADN méta-génomique. Ces nouveaux développements permettent maintenant de caractériser la diversité des communautés microbiennes du sol en se basant sur un marqueur phylogénétique comme l'ADNr 16S, aussi appelée MetaTaxogénomique (Maron et coll., 2011). Toutefois, dans un contexte ou l’écologie microbienne du sol commence à s’a…
Comparaison de l'arisa et du séquençage haut débit pour l'étude des processus de diversification des communautés microbiennes du sol
2013
EA SPE EcolDur GenoSol; National audience
Dynamique, diversité et adaptation des communautés microbiennes du sol en réponse à différents types de perturbations environnementales : influence d…
2009
Connectivité d’un paysage agricole et processus de dispersion des adventices. Approche par l’analyse de la similarité des communautés
2013
Rapport de Stage de Master 2 Sciences, Technologies et Santé (STS) SPE ECOLDUR équipe CAPA; Master; Comprendre la connectivité fonctionnelle d’un paysage pour une espèce ou un groupe d’espèces donné revient à rechercher des distances écologiques pertinentes vis-à-vis de la dispersion de ces organismes. Pour cela, la similarité dans la composition en espèce entre communautés, qui mesure leur degré de ressemblance, peut être mise en relation avec des distances écologiques entre ces communautés qui sont issues de mesures de connectivité du paysage, et qui reposent sur des hypothèses concernant les processus de dispersion. Au sujet des adventices des cultures, une hypothèse est que la prise en …
La nature du sol et la composition floristique comme facteurs de modulation de la diversité et de la fonctionnalité des communautés microbiennes en p…
2019
National audience; La composition floristique, le mode d’exploitation (fauche, pâturage), l’intensité d’exploitation (chargement, fréquence des coupes, fertilisation) et la pérennité de la couverture végétale sont connus comme étant des facteurs déterminants du fonctionnement des prairies permanentes (Gaujour et al. 2012). Ces pratiques de gestion peuvent modifier les stocks de C directement en modulant les entrées de matières organiques (MO) (litière et/ou effluents d’élevage) et indirectement en orientant la composition et le fonctionnement des communautés végétales ce qui pourrait agir sur le temps de résidence et la localisation de la MO (Hassink et Neeteson 1991). Ce projet a pour obje…