Search results for "foldameerit"
showing 3 items of 3 documents
Foldameerien isäntä-vieraskemia
2017
Tutkielman kirjallisessa osassa tarkastellaan foldameerejä isäntä-vieraskemian näkökulmasta. Foldameerit voivat sitoa rakenteeseensa erilaisia vierasmolekyylejä, jolloin muodostuu isäntä-vieraskomplekseja. Kirjallisuudesta valittiin tarkasteluun mielenkiintoisimpia anioneja, kationeja ja neutraaleja vierasmolekyylejä sitovia foldameereja ja perehdyttiin niiden vuorovaikutuksiin. Lisäksi tarkasteltiin vierasmolekyylin sitoutumisen aikaansaamia muutoksia foldameerien konformaatiossa. Kokeellisen osan tarkoituksena oli syntetisoida pitkä, 11 aromaattista rengasta sisältävä aryyliamidifoldameeri käyttäen hyväksi pääasiassa peptidikytkentäreaktioita. Koska synteesi osoittautui erittäin haasteell…
Solid state conformational behavior and interactions of a series of aromatic oligoamide foldamers
2016
The topic of this thesis is aromatic oligoamide foldamers. The literary review of the thesis discusses the general features of foldamers and their design and then focuses on the specific examples of aromatic oligoamide foldamers. The experimental part of the thesis discusses the design and preparation of a family of aromatic oligoamide foldamers that can adopt a helical conformation. The folding is directed by intramolecular hydrogen bonding and stabilized by intramolecular aromatic interactions. The focus of the thesis is the analysis of the solid state conformations of ten foldamer analogues. The analysis is based on forty different crystal structures which are determined using single cry…
Laskennalliset menetelmät foldameeritutkimuksessa
2016
Foldameerit ovat oligomeerejä, joilla on stabiili sekundäärirakenne eli niillä on kyky laskostua. Foldameerien syntetisointi ja karakterisointi on usein melko vaikeaa. Tästä syystä niiden rakenteen ja ominaisuuksien tutkimiseksi on kehitelty useita erilaisia laskennallisia malleja. Laskennalliset menetelmät jakautuvat kvanttimekaniikan menetelmiin ja molekyylidynamiikkaan. Molekyylidynamiikka perustuu klassiseen mekaniikkaan. Siinä yksittäisiä atomeja käsitellään palloina, joilla on muuttumaton varaus. Atomien väliset sidokset on yksinkertaistettu jousiksi, joilla on tasapainotila, joka on sama kuin kokeellinen tai laskennallinen sidospituus. Kvanttimekaniikan menetelmillä voidaan tutkia mo…