Search results for "peptidit"

Best Practices in Constant pH MD Simulations: Accuracy and Sampling

2022

Various approaches have been proposed to include the effect of pH in molecular dynamics (MD) simulations. Among these, the λ-dynamics approach proposed by Brooks and co-workers [Kong, X.; Brooks III, C. L. J. Chem. Phys.1996, 105, 2414−2423] can be performed with little computational overhead and hfor each typeence be used to routinely perform MD simulations at microsecond time scales, as shown in the accompanying paper [Aho, N. et al. J. Chem. Theory Comput.2022, DOI: 10.1021/acs.jctc.2c00516]. At such time scales, however, the accuracy of the molecular mechanics force field and the parametrization becomes critical. Here, we address these issues and provide the community with guidelines on…

Activities of angiotensin-converting enzymes (ACE1, ACE2) and inhibition by bioactive lactotripeptides (IPP, VPP, LPP) in porcine ocular tissues

2009

Development of baculovirus display strategies towards targeting to tumor vasculature

2006

Matilaisen väitöstutkimuksen tavoitteena oli kehittää bakulovirusta käytettäväksi geeniterapiaan syövän hoitoon. Bakulovirus on hyönteisvirus ja siten turvallisempi vaihtoehto kokeellisessa geeniterapiassa tällä hetkellä käytettäville patogeenisille viruksille tai niiden muunnelmille.Matilainen tutki myös virusten ja käytettyjen kohdennuspeptidien sisääntulomekanismeja ihmisen syöpäsoluihin. Tutkimuksessa löydettiin mahdollisesti bakuloviruksen uusi vaihtoehtoinen sisääntuloreitti. Virusten ja kohdennusmolekyylien reseptoreiden sisääntulomekanismien tutkimus ja tunteminen on edellytyksenä onnistuneiden geeninsiirtojen aikaansaamiselle ja täten myös onnistuneelle geeniterapialle.Matilainen k…