Search results for "proteiini"

Vierasmolekyylien sitoutumisen mallintaminen lipokaliiniproteiineissa

2008

Tässä työssä tutkittiin DigA16- ja 1KT7-proteiineja. Proteiineille suoritettiin klassisia MD-simulaatioita käyttämällä Orac4.0-ohjelmistoa. DigA16-proteiinin kokeellisesti mitattu rakenne täydennettiin tietokoneella ja kokonaisesta proteiinista simuloitiin kolmea eri rakennetta. 1KT7-proteiinin simulaation lähtörakenteena oli kokeellisesti mitattu rakenne, jota ei tarvinnut täydentää. Simulaatioita suoritettiin kutakin 10,751 nanosekunnin verran, joista 0,751 ns oli alustusta ja 10 ns simulointia 300 Kelvinissä. Tästä 10 ns vaiheesta kerättiin analysoitu data. Simulaation aikana kokonaisenergia kasvoi tasaisesti. Kasvu oli niin pientä, että sen voidaan katsoa johtuneen täysin MD-simulaatios…

Liikunnan ja hera- tai proteiinijuomadieetin vaikutukset sirtuiinien 1-7 ilmentymiseen LCR-rottien raajalihaksessa

2014

Anne Mäkinen (2014). Liikunnan ja hera- tai proteiinijuomadieettien vaikutukset sirtuiinien 1-7 ilmentymiseen LCR -rottien raajalihaksessa. Liikuntabiologian laitos, Jyväskylän yliopisto, Liikuntafysiologian pro gradu-tutkielma, 41 s. Histonit ja muut kromosomaaliset proteiinit pakkautuvat DNA:n (deoksiribonukleiinihapon) tumaan. Histonideasetylaasit kontrolloivat osaltaan geenien ilmentymistä. Ryhmän III histonideasetylaaseja nimitetään sirtuiineiksi, joita on seitsemän kappaletta ja niiden toiminta on riippuvainen NAD+:sta (nikotiinihappoamidiadeniinidinukleotidi). Tutkimuksissa on todettu liikunnan lisäävän joidenkin sirtuiinien ilmentymistä, mutta proteiinin tai heran vaikutuksia sirtui…

Production, purification and evaluation of insect cell-expressed proteins with diagnostic potential

2008

Patrik Michelin väitöskirjan aiheena on useiden erityyppisten rekombinanttiproteiinien tuotto, puhdistus ja karakterisointi. Rekombinanttiproteiinit ovat keskeisessä asemassa kehitettäessä uusia diagnostisia menetelmiä. Näiden proteiinien tuotossa organismiin lisätään muokattua vierasta geneettistä materiaalia, jotta organismi tuottaisi tavoiteltua proteiinia. Tuottoprosessit sisältävät puhdistusvaiheita, jotta haluttu proteiini voidaan eristää elävästä, monimutkaisesta lähtömateriaalista. Tuottoprosessissa on ainakin seuraavat vaiheet: tuotto-organismin kasvatus, rekombinanttiproteiinien tuotto isäntäsolussa ja lopputuotteen jälkikäsittely. Tämän jälkeen rekombinanttiproteiineja voidaan kä…

Integriini β3:n liitetyn vihreää fluoresoivan proteiinin vaikutus solujen tarttumiseen

2009

Gimap3 & Gimap5 in apoptosis

2011

Intracellular delivery of baculovirus and streptavidin-based vectors in vitro : towards novel therapeutic applications

2008

Geeniterapia on kokeellinen lääketieteellinen hoitomuoto, jonka pyrkimyksenä on korvata solujen perintöaineksen puuttuva tai vaurioitunut geeni ja sen tuote. Toistaiseksi geeniterapian kliiniset kokeet ovat kohdistuneet pääasiassa syövän, sydän- ja verisuonisairauksien ja yksittäisten geenivirheiden aiheuttamien sairauksien hoitoon.Geenien kuljettamiseen soluihin, kudoksiin tai elimiin käytetään joko synteettisiä tai virusperäisiä kuljettimia. Kuljettimien kehittämisessä kuhunkin tautimalliin sopivaksi on kuitenkin vielä monia haasteita, kuten syntyvät immuniteettireaktiot sekä hoitogeenin ilmentymisen riittävä tehokkuus kohdekudoksessa. Johanna Laakkonen seurasi väitöstutkimuksessaan lupaa…

A DNA‐Encoded FRET Biosensor for Visualizing the Tension across Paxillin in Living Cells upon Shear Stress

2022

Paxillin is a potential participant in the direct intracellular force transmission which is considered as the foundation of cells sensing and responding to extracellular environment. However, the detection of tension across paxillin has not been achieved due to lacking microsized tools. Herein, a paxillin tension sensor (PaxTs) based on Fluorescence Resonance Energy Transfer (FRET) technique was constructed. PaxTs can be expressed and assembled to FA sites spontaneously to visualize the tension across paxillin with FRET efficiency of ~62.4% in living cells. The tension across paxillin was found to decrease upon shear stress, in which the membrane fluidity and contractility of actin acted as…

Tuning protein adsorption on graphene surfaces via laser-induced oxidation

2021

An approach for controlled protein immobilization on laser-induced two-photon (2P) oxidation patterned graphene oxide (GO) surfaces is described. Selected proteins, horseradish peroxidase (HRP) and biotinylated bovine serum albumin (b-BSA) were successfully immobilized on oxidized graphene surfaces, via non-covalent interactions, by immersion of graphene-coated microchips in the protein solution. The effects of laser pulse energy, irradiation time, protein concentration and duration of incubation on the topography of immobilized proteins and consequent defects upon the lattice of graphene were systemically studied by atomic force microscopy (AFM) and Raman spectroscopy. AFM and fluorescence…

Uuden bakteeriperäisen avidiinin sukulaisproteiinin tuottaminen, puhdistus sekä sen ominaisuuksien määrittäminen

2007

Nutritional intake and anthropometric characteristics are associated with endurance performance and markers of low energy availability in young femal…

2023

Background Low energy availability (LEA) can have negative performance consequences, but the relationships between LEA and performance are poorly understood especially in field conditions. In addition, little is known about the contribution of macronutrients to long-term performance. Therefore, the aim of this study was to evaluate if energy availability (EA) and macronutrient intake in a field-based situation were associated with laboratory-measured performance, anthropometric characteristics, blood markers, training volume, and/or questionnaire-assessed risk of LEA in young female cross-country (XC) skiers. In addition, the study aimed to clarify which factors explained performance. Metho…