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Cytoplasmic 5′-3′ exonuclease Xrn1p is also a genome-wide transcription factor in yeast
2014
The 5′ to 3′ exoribonuclease Xrn1 is a large protein involved in cytoplasmatic mRNA degradation as a critical component of the major decaysome. Its deletion in the yeast Saccharomyces cerevisiae is not lethal, but it has multiple physiological effects. In a previous study, our group showed that deletion of all tested components of the yeast major decaysome, including XRN1, results in a decrease in the synthetic rate and an increase in half-life of most mRNAs in a compensatory manner. Furthermore, the same study showed that the all tested decaysome components are also nuclear proteins that bind to the 5′ region of a number of genes. In the present work, we show that disruption of Xrn1 activi…
Estudio de la adaptación a estrés por etanol en cepas de Saccharomyces cerevisiae
2016
Los mecanismos de tolerancia a etanol han sido ampliamente estudiados en la levadura Saccharomyces cerevisiae debido a su importancia en el sector industrial de bebidas fermentadas y obtención de biocombustibles, siendo las cepas de laboratorio las más utilizadas en los estudios experimentales. A pesar del gran número de estudios llevados a cabo, nuestra comprensión de la respuesta transcripcional y fisiológica al etanol continúa siendo limitada debido al uso de cepas no adecuadas para este fin y la gran disparidad en las condiciones utilizadas. Además se ha dejado de lado el estudio de ciertas rutas de respuesta a estrés en levaduras, como la respuesta a proteínas desplegadas (UPR), cuya a…
Obtención, estabilización y selección de levaduras híbridas de Saccharomyces de interés enológico.
2015
El género Saccharomyces se compone de 7 especies: S. arboricolus, S. cerevisiae, S. eubayanus, S. kudriavzevii, S. mikatae, S. paradoxus y S. uvarum. Además, en el género Saccharomyces podemos encontrar dos grandes grupos de híbridos S. pastorianus (S. cerevisiae x S. uvarum x S. eubayanus) y S. bayanus (S. uvarum x S. eubayanus), así como un número menor de híbridos que poseen porciones de S. kudriavzevii. Entre estas, se encuentran las especies de levaduras más importantes implicadas en procesos fermentativos. Aunque uno de los mecanismos más interesantes observados en la adaptación de las levaduras a procesos industriales es la formación de híbridos entre especies de este grupo. En los ú…
Characterization and improvement of non-conventional Saccharomyces yeasts to solve new challenges in the wine industry: Application of omics technolo…
2021
Las levaduras Saccharomyces participan en procesos fermentativos de valor en la industria alimentaria, como la elaboración de vino. La industria del vino utiliza levaduras seleccionadas para realizar la fermentación del vino de forma controlada y para producir un vino homogéneo. En la actualidad, S. cerevisiae es la especie del género Saccharomyces más utilizada en la industria vitivinícola para llevar a cabo el proceso fermentativo, por ser muy resistente al etanol, compuesto tóxico que se produce durante las fermentaciones. Hoy en día, como consecuencia del cambio climático, los vinos finales contienen niveles de alcohol y pH más altos y una acidez total menor a la esperada, característic…
Mecanismos de percepción y de respuesta a bajas temperaturas en Saccharomyces cerevisiae
2014
A lo largo de los años, la levadura S. cerevisiae se ha convertido en organismo modelo tanto en la industria, como en el campo de la investigación básica, debido a sus características metabólicas y su fácil manipulación. Es conocido que, cuando la célula se enfrenta a una situación de estrés, debe modificar su fisiología para mantener la homeostasis celular. En el ámbito industrial, el aumento en la demanda de levaduras con características especiales, ha hecho patente la necesidad de nuevas cepas que se adecuen a los requerimientos y necesidades del consumidor. En esta línea, las estrategias de mejora y selección de cepas industriales se ven limitadas por el escaso conocimiento que disponem…
Caracterización bioquímica de levaduras vínicas no-saccharomyces y adaptación tecnológica de su producción industrial como levadura seca activa
2020
Programa de Doctorado en Biomedicina y Biotecnología: Tesis doctoral presentada por Max Torrellas Marcó para optar al grado de Doctor por la Universitat de València.
Ricerca di lieviti autoctoni per migliorare il profilo aromatico delle birre artigianali
2019
In corso d’opera un’analisi di matrici appartenenti a diverse nicchie ecologiche con l’obiettivo di individuare lieviti dalle caratteristiche tecnologiche e qualitative ottimali
Improvement of xylose fermentation of Saccharomyces cerevisiae
2012
The increasing need of oil and the negative impacts of fossil fuels on climate change have motivated the research towards environmental friendly alternatives to diminish the use of fossil resources. Until today, bioethanol production and use has increased worldwide. The raw materials used today compete with food industry and conquently, the ethanol production from lignocellulose has been developed intensively. However, to make the processes economically competitive, also pentoses in lignocellulose should be fermented at high rate. Saccharomyces cerevisiae, alias baker’s yeast has an excellent ethanol production capacity but it can not naturally utilize xylose. Several xylose-utilizing S. ce…
Caracterización de los componentes genéticos y ambientales implicados en el envejecimiento de las levaduras vínicas
2012
La mayor parte de la fermentación vínica discurre cuando las células de la levadura Saccharomyces cerevisiae han dejado de dividirse. Así pues, la viabilidad en fase estacionaria, llamada longevidad cronológica (LC), es esencial para que la vinificación se lleve a buen término. En este trabajo de tesis doctoral, se han caracterizado diversos componentes ambientales y genéticos que influyen en la longevidad cronológica de las levaduras vínicas. En cuanto a los componentes ambientales, el incremento de la acidez y la temperatura del medio promueven el envejecimiento. Los polifenoles resveratrol y quercetina y los compuestos de dos carbonos que se producen durante la fermentación, afectan de m…
Xrn1 influence on gene transcription results from the combination of general effects on elongating RNA pol II and gene-specific chromatin configurati…
2020
mRNA homoeostasis is favoured by crosstalk between transcription and degradation machineries. Both the Ccr4-Not and the Xrn1-decaysome complexes have been described to influence transcription. While Ccr4-Not has been shown to directly stimulate transcription elongation, the information available on how Xrn1 influences transcription is scarce and contradictory. In this study we have addressed this issue by mapping RNA polymerase II (RNA pol II) at high resolution, using CRAC and BioGRO-seq techniques in Saccharomyces cerevisiae. We found significant effects of Xrn1 perturbation on RNA pol II profiles across the genome. RNA pol II profiles at 5ʹ exhibited significant alterations that were com…