Search results for "tila-avaruusmalli"

bssm: Bayesian Inference of Non-linear and Non-Gaussian State Space Models in R

2021

We present an R package bssm for Bayesian non-linear/non-Gaussian state space modelling. Unlike the existing packages, bssm allows for easy-to-use approximate inference based on Gaussian approximations such as the Laplace approximation and the extended Kalman filter. The package accommodates also discretely observed latent diffusion processes. The inference is based on fully automatic, adaptive Markov chain Monte Carlo (MCMC) on the hyperparameters, with optional importance sampling post-correction to eliminate any approximation bias. The package implements also a direct pseudo-marginal MCMC and a delayed acceptance pseudo-marginal MCMC using intermediate approximations. The package offers …

Otsoniaineiston analysointi lineaarisella tila-avaruusmallilla

2014

Tutkielma käsittelee yläilmakehän otsonimäärän mallintamista lineaarisella tila-avaruusmallilla. Ilmakehän otsonimäärä vaihtelee vuodenajan mukaan ja lisäksi tunnetaan joitakin luonnollisia tekijöitä, jotka vaikuttavat otsonimäärään. Tämän lisäksi erilaiset ihmisen toiminnan vuoksi ilmakehässä lisääntyneet aineet aiheuttavat muutoksia otsonimäärässä. Aiemmin otsonimäärää on mallinnettu yleistettyjen lineaaristen mallien avulla. Tila-avaruusmallit ovat kuitenkin huomattavasti monipuolisempia malleja, joilla voidaan hyvin mallintaa ajassa tapahtuvaa kehitystä. Mallin sovittamisessa käytetään modernia MCMC-algoritmia. Aineistona käytetään kahden eri satelliitti-instrumentin havaintoja otsonimä…

Eksponenttisen perheen tila-avaruusmallien sovellus alkoholikuolleisuusaineistoon

2009

Prediction and interpolation of time series by state space models

2015

Artikkeliväitöskirja. Sisältää yhteenveto-osan ja neljä artikkelia. Article dissertation. Contains an introduction part and four articles. A large amount of data collected today is in the form of a time series. In order to make realistic inferences based on time series forecasts, in addition to point predictions, prediction intervals or other measures of uncertainty should be presented. Multiple sources of uncertainty are often ignored due to the complexities involved in accounting them correctly. In this dissertation, some of these problems are reviewed and some new solutions are presented. A state space approach is also advocated for an e cient and exible framework for time series forecas…

Myyräkuumeen ja myyrärunsauden välisen suhteen mallintaminen tila-avaruusmalleilla

2016

Tutkielma käsittelee myyräkuumeen mallintamista tila-avaruusmalleilla. Tutkin myyrärunsauksien ja myyräkuumetapausten välistä riippuvuutta ja selvitän, voidaanko myyrärunsauksilla ennustaa tulevia myyräkuumetapausten lukumääriä. Sen lisäksi selvitän, kuinka monen kuukauden viiveellä myyräkuumetapaukset ilmenevät suhteessa myyrärunsauksiin. Sekä myyrärunsaudet että myyräkuumetapausten lukumäärät vaihtelevat vuodenajan mukaan. Myyräkuumetapausten aineisto on kerätty Terveyden ja hyvinvoinnin laitoksen tartuntatautirekisterin tilastotietokannasta ja myyrärunsausaineisto on saatu Jyväskylän yliopiston Bio- ja ympäristötieteiden laitokselta. Molempien aikasarjojen alkamisvuosi on 1995. Myyräruns…

Valkosolupitoisuuksien bayesilainen mallintaminen lasten leukemian ylläpitohoidossa

2018

Lasten akuutin lymfoblastileukemian ylläpitovaiheen hoidossa tehtävät lääkeannostuspäätökset pohjataan nykyisin potilaan veren valkosolupitoisuuteen, joka on hoidon tehokkuudesta kertova tekijä. Potilaalle sopiva lääkeannostus on hoidon onnistumisen ja turvallisuuden kannalta tärkeä, mutta sen löytäminen on vaikeaa, sillä annettu lääkitys näkyy valkosolupitoisuudessa viiveellä, ja potilaiden elimistön reagointi lääkitykseen on yksilöllistä. Sopivan lääkeannostuksen löytämistä hankaloittavat myös hoidonaikaiset tulehdukset, jotka voivat muuttaa valkosolupitoisuutta hetkellisesti. Työ käsittelee akuuttiin lymfoblastileukemiaan sairastuneiden suomalaisten potilaiden veren valkosolupitoisuuden …