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AUTHOR
Samuel Soubeyrand
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Spatiotemporal Structure of Host‐Pathogen Interactions in a Metapopulation
2009
International audience; The ecological and evolutionary dynamics of species are influenced by spatiotemporal variation in population size. Unfortunately, we are usually limited in our ability to investigate the numerical dynamics of natural populations across large spatial scales and over long periods of time. Here we combine mechanistic and statistical approaches to reconstruct continuous-time infection dynamics of an obligate fungal pathogen on the basis of discrete-time occurrence data. The pathogen, Podosphaera plantaginis, infects its host plant, Plantago lanceolata, in a metapopulation setting where the presence of the pathogen has been recorded annually for 6 years in similar to 4,00…
A nonstationary cylinder-based model describing group dispersal in a fragmented habitat
2014
International audience; A doubly nonstationary cylinder-based model is built to describe the dispersal of a population from a point source. In this model, each cylinder represents a fraction of the population, i.e., a group. Two contexts are considered: The dispersal can occur in a uniform habitat or in a fragmented habitat described by a conditional Boolean model. After the construction of the models, we investigate their properties: the first and second order moments, the probability that the population vanishes, and the distribution of the spatial extent of the population.
Dynamiques de populations en milieu hétérogène : modèles et estimation de paramètres
2017
Prod 2017-344i SPE équipe EA GESTAD INRA; National audience; Cet exposé traite de (i) la modélisation de dynamiques de populations dans des paysages hétérogènes, (ii) la modélisation des paysages eux-mêmes, (iii) l'estimation des paramètres de ces modèles à partir de données d'abondance ou de données génétiques. Nous nous concentrerons sur deux grandes classes de modèles de dynamique des populations : les modèles individu-centrés basés sur des équations différentielles stochastiques, et les modèles de réaction-diffusion. Après une introduction du lien entre ces approches, 5 illustrations issues des projets sont présentées: - modélisation de paysages hétérogènes fragmentés, via l’outil MULTI…