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RESEARCH PRODUCT

Dynamiques de populations en milieu hétérogène : modèles et estimation de paramètres

Olivier BonnefonLionel RoquesY. BourhisPierre FranckEtienne KleinNicolas PariseySylvain PoggiBenoit RicciSamuel SoubeyrandEmily Walker

subject

[SDE] Environmental Sciencesmodelisation du paysage[SDV]Life Sciences [q-bio]modeles de reaction-diffusiondonnees genetiquesmodeles discrets/continus;[MATH] Mathematics [math][INFO] Computer Science [cs][SDV] Life Sciences [q-bio]equations aux derivees partiellesmodeles 2d/1d[SDE]Environmental Sciences[SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology[SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biologyapproches mecanisticostatistiques[INFO]Computer Science [cs]equations differentielles stochastiques[MATH]Mathematics [math]

description

Prod 2017-344i SPE équipe EA GESTAD INRA; National audience; Cet exposé traite de (i) la modélisation de dynamiques de populations dans des paysages hétérogènes, (ii) la modélisation des paysages eux-mêmes, (iii) l'estimation des paramètres de ces modèles à partir de données d'abondance ou de données génétiques. Nous nous concentrerons sur deux grandes classes de modèles de dynamique des populations : les modèles individu-centrés basés sur des équations différentielles stochastiques, et les modèles de réaction-diffusion. Après une introduction du lien entre ces approches, 5 illustrations issues des projets sont présentées: - modélisation de paysages hétérogènes fragmentés, via l’outil MULTILAND (http://multiland.biosp.org) ; - modélisation de dynamiques de population sur des paysages réalistes (2D) traversés par des couloirs de déplacement (1D) (routes, haies, rivières, via un système d'équations 2D/1D . Application de ce modèle à des données de propagation du moustique Aedes albopictus, en utilisant une approche mécanistico-statistique (Roques & Bonnefon 2016); - étude simulatoire de l’effet de l’allocation des sols sur une population de carabiques auxiliaires de culture, dont les caractéristiques démographiques sont estimées à partir de piégeage. Utilisation d’un système de réaction-diffusion pour décrire la dynamique des carabiques et approche mécanistico-statistique pour l’estimation des paramètres (Parisey et al 2016) ; - description d’une nouvelle méthode d’estimation de paramètres de modèles individu-centrés basés sur des EDS. Liens avec les équations aux dérivées partielles et les processus ponctuels ; comparaison entre données de comptage et données géo-localisées; - méthode pour l’estimation de paramètres de dispersion à partir de données génétiques (Roques et al 2016).

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