Crypthecodinium cohnii metabolisma matemātiskā modelēšana DHA ražošanas optimizācijai

2020

Datormodelēšana un bioķīmisko ceļu simulēšana ir sistēmbioloģijas pamatnostādnes, un pastāv vairākas metodes, kas var palīdzēt šo sistēmu izpētīšanā. Darbā izmantota divu sistēmbioloģijas modelēšanas metožu pieeja šūnu taukskābju sintēzes metabolisma pētīšanai. Darba ietvaros izveidots kinētiskais modelis, kas ietver glikolīzes ceļa reakcijas un reakcijas, kas ved līdz taukskābju sintezējošajam enzīmam- FAS, kā arī pilnveidots genoma izmēra metaboliskais modelis dinoflagellātam Crypthecodinium cohnii. Kinētiskais modelis tika parametrizēts saskaņā ar pieejamajiem eksperimentālajiem datiem. Aplūkoti stehiometriskajā modelī ietvertie metabolisma regulācijas mehānismi taukskābju sintēzei un ga…