Annotation of microsporidian genomes using transcriptional signals
EA GenoSol CT3; International audience; High-quality annotation of microsporidian genomes is essential for understanding the biological processes that govern the development of these parasites. Here we present an improved structural annotation method using transcriptional DNA signals. We apply this method to re-annotate four previously annotated genomes, which allow us to detect annotation errors and identify a significant number of unpredicted genes. We then annotate the newly sequenced genome of Anncaliia algerae. A comparative genomic analysis of A. algerae permits the identification of not only microsporidian core genes, but also potentially highly expressed genes encoding membrane-asso…
Animation scientifique et technique sur "La microbiologie moléculaire au service du diagnostic environnemental"
INRA EA BIOmEINRAEABIOmE; Dans une société où il devient urgent de réduire l’empreinte environnementale des activités humaines, l’établissement d’un diagnostic fiable de la qualité des divers écosystèmes (terrestres, aquatiques, atmosphériques) est une priorité absolue. Les microorganismes, de par leur petite taille, leur énorme diversité taxonomique et fonctionnelle, leurs capacités d’adaptations aux perturbations et leur forte implication dans les cycles biogéochimiques sont des candidats incontournables pour élaborer ce diagnostic