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AUTHOR
Xavier Nesme
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Immobilization of single-stranded DNA fragments to solid surfaces and their repeatable specific hybridization : covalent binding or adsorption ?
2004
Abstract The different steps of the immobilization process of single-stranded DNA (ssDNA) on surfaces by means of chemical grafting have been investigated using systematic measurements of grafting and hybridization densities by means of radioactive labelling. The immobilization by chemical grafting to a dense monomolecular layer of N-hydroxysuccinimidyl ester reactive functions attached to silica plates was performed from a dilute solution of amino-terminated oligonucleotides (10 μmol/l). The slow evaporation of the solvent allowed to increase the DNA grafting density by a factor of 10. A precise control of the rinsing process that followed the immobilization reaction allowed the discrimina…
Relationships between Staphylococcus aureus genetic background, virulence factors, agr groups (alleles), and human disease
2002
ABSTRACT The expression of most Staphylococcus aureus virulence factors is controlled by the agr locus, which encodes a two-component signaling pathway whose activating ligand is an agr -encoded autoinducing peptide (AIP). A polymorphism in the amino acid sequence of the AIP and of its corresponding receptor divides S. aureus strains into four major groups. Within a given group, each strain produces a peptide that can activate the agr response in the other member strains, whereas the AIPs belonging to different groups are usually mutually inhibitory. We investigated a possible relationship between agr groups and human S. aureus disease by studying 198 S. aureus strains isolated from 14 asym…
Direct conjugal transfers of Ti plasmid to soil microflora
2002
The bacterial species in soil that can receive a Ti plasmid by conjugation from Agrobacterium spp. were investigated. In order to have direct access to the potential reservoir of Ti plasmid amongst soil microflora, the conjugal system consisting of a multiply auxotrophic derivative of C58 (ST-96-4) and a derivative of pTiC58Delta(acc)R (pSTiEGK) containing a triple antibiotic-resistance cassette in traM was used to transfer the Ti plasmid in a complex soil microflora used as the recipient. Numerous transconjugants were obtained by this method but none was identified as Agrobacterium. This could be explained by the low density of Agrobacterium in the tested soil. As indicated by analysis of …
A mathematical method for determining genome divergence and species delineation using AFLP.
2002
The delineation of bacterial species is presently achieved using direct DNA-DNA relatedness studies of whole genomes. It would be helpful to obtain the same genomically based delineation by indirect methods, provided that descriptions of individual genome composition of bacterial genomes are obtained and included in species descriptions. The amplified fragment length polymorphism (AFLP) technique could provide the necessary data if the nucleotides involved in restriction and amplification are fundamental to the description of genomic divergences. Firstly, in order to verify that AFLP analysis permits a realistic exploration of bacterial genome composition, the strong correspondence between …
Seasonal fluctuations and long-term persistence of pathogenic populations of Agrobacterium spp. in soils.
2002
ABSTRACT Short- and long-term persistence of pathogenic (i.e., tumor forming) agrobacteria in soil was investigated in six nursery plots with a history of high crown gall incidence. No pathogenic Agrobacterium strains were isolated in soil samples taken in fall and winter in any plots, but such strains were isolated from both bulk soils and weed rhizospheres (over 0.5 × 10 5 pathogenic CFU/g of bulk soil or rhizosphere) in three out of six plots in spring and summer. PCR amplifications of a vir sequence from DNA extracted from soil confirmed the presence of Ti plasmids in summer and their absence in fall and winter. The results indicate that strains that harbor a Ti plasmid had an unforesee…
Connaissances nécessaires à la gestion du risque "écorces sensibles au nématode du pin"
2018
Connaissances nécessaires à la gestion du risque "écorces sensibles au nématode du pin"
Stratégies de lutte contre le charançon rouge du palmier
2018
La communauté scientifique internationale (source : publication FAO d’avril 2017) s’accorde sur l’importance de la combinaison des mesures de lutte en fonction des niveaux d’infestation par le charançon rouge du palmier. Plusieurs mesures de lutte sont disponibles ou envisageables : assainissement mécanique, application d’insecticides à titre préventif ou curatif, piégeage de masse et biocontrôle (lutte biologique sensu stricto). Il est à noter que plusieurs expérimentations sur le biocontrôle sont en cours.Dans la perspective d’améliorer les stratégies de lutte contre le charançon rouge du palmier, il est demandé : 1) d’identifier les stratégies de lutte (en tant que combinaison de différe…
Risque phytosanitaire (ARP) portant sur Fusarium oxysporum f. sp. cubense (agent pathogène responsable de la maladie de Panama) pour les départements…
2018
Risque phytosanitaire (ARP) portant sur [i]Fusarium oxysporum[/i] f. sp.[u] cubense[/u] (agent pathogène responsable de la maladie de Panama) pour les départements d'Outre-mer
Risques et bénéfices relatifs des alternatives aux produits phytopharmaceutiques comportant des néonicotinoïdes
2018
Risques et bénéfices relatifs des alternatives aux produits phytopharmaceutiques comportant des néonicotinoïdes. Tome 1 – Rapport du groupe de travail Identification des alternatives aux usages autorisés des néonicotinoïdes
Maladie du huanglongbing
2019
Maladie du huanglongbing. Analyse du risque phytosanitaire pour l’Union européenne
Réalisation d'une analyse de risques relative au houblon du Japon et élaboration de recommandations de gestion
2018
Réalisation d'une analyse de risques relative au houblon du Japon et élaboration de recommandations de gestion
Demande d’avis relatif à la réalisation d’une analyse de risques relative à l’ambroisie trifide (Ambrosia trifida L.) et pour l’élaboration de recomm…
2017
Le 22 octobre 2014, le Parlement européen et le Conseil ont publié un règlement relatif à la prévention et à la gestion de l'introduction et de la propagation des espèces exotiques envahissantes (EEE). Ce règlement prévoit, en particulier àson article 19, que les États membres mettent en place des mesures efficaces de gestion vis-à-vis d'une liste d'EEE dites préoccupantes pour l'Union Européenne (UE) qui, selon l'article 4, doit être adoptée, par voie d'actes d'exécution, par la Commission européenne début 2016. Cette liste sera régulièrement révisée. Ainsi l'inscription d'une espèce dans cette liste se traduira par la mise en place d'actions de prévention et de lutte coordonnées entre les…