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AUTHOR
Jeanne Gardin
showing 4 related works from this author
A transcriptomics-based approach enables the first identification of candidate genes involved in non-target-site-based resistance to herbicides in a …
2013
International audience; Herbicides are the most effective way to control weeds. Yet, the evolution of resistance in many weed species is a considerable threat to herbicide efficacy. Non-target-site-based resistance (NTSR) is the most threatening facet of herbicide resistance. NTSR is widespread, involves a variety of mechanisms, and can confer unpredictable resistance to herbicides, regardless of the herbicide mode of action. Because NTSR is endowed by differences in the expression of a number of genes in resistant and sensitive weed plants, few genes governing NTSR are currently known. This renders NTSR diagnosis and management tricky. The rise of next-generation sequencing technologies no…
Caractérisation de la réponse transcriptionnelle du vulpin des champs (Alopecurus myosuroides) à des herbicides inhibiteurs de l’acétyle-coenzyme A c…
2014
L’objectif de cette thèse était d’étudier les mécanismes génétiques de la résistance non liée à la cible à des herbicides appartenant aux groupes des inhibiteurs de l’acétyl-coenzyme A carboxylase (ACCase) et de l’acétolactate synthase (ALS) chez le vulpin des champs (Alopecurus myosuroides Huds.), une graminée adventice non modèle d’importance agronomique. Deux méthodes de transcriptomique ont été employées : l’hybridation soustractive suppressive (SSH) et le séquençage de transcriptome complet (RNA-seq). La SSH a permis d’identifier des transcrits potentiellement en cause dans la RNLC au fénoxaprop, à l’haloxyfop (inhibiteurs de l’ACCase) ou au pyroxsulame (inhibiteur de l’ALS). La surexp…
Identification de mécanismes de résistance non liée à la cible grâce à la transcriptomique
2013
We have witnessed a dramatic increase in the number of weeds showing herbicide resistance during the past three decades. The potentially most dangerous mechanisms of resistance endows Non-Target-Site based Resistance (NTSR): NTSR is polygenic, unpredictable and can confer cross-resistance to herbicides with different modes of action. High throughput sequencing methods, like RNA sequencing (RNA-seq), are particularly effective to identify genes differentially expressed between two experimental modalities. Therefore, RNA sequencing was implemented to identify genes involved in NTSR to clodinafop (an ACCase inhibitor) in black-grass. Black-grass transcriptome was sequenced from 4 sensitive pla…
Vulpin, résistance non liée à la cible ou RNLC: Une armée de clones mobilisés pour la cerner: des difficultés à prêvoir pour la lutte contre le vulpi…
2011
National audience; Dans deux parcelles, l'emploi systématique d'herbicides inhibiteurs de l'ACCase, puis d'inhibiteurs de l'ALS, a sélectionné des plantes de vulpin résistantes à la plupart des substances ayant ces modes d'action (fénoxaprop, clodinafop, pinoxaden, quizalofop, iodosulfuron+mésosulfuron et pyroxsulame). Ces plantes ne contiennent pas de mutations de l'ACCase ou de l'ALS, et sont uniquement résistantes par des mécanismes de résistance non liée à la cible (RNLC). Les solutions chimiques restant potentiellement disponibles pour les contrôler sont limitées et impliquent un plus grand nombre d'applications. En l'absence de nouveaux modes d'action et de capacité à détecter rapidem…