SEQPACKER: A Biologist-Friendly User Interface to Manipulate Nucleotide Sequences in Genomic Epidemiology
The aim of this paper is to present a new integrated bioinformatics tool for manipulating nucleotide sequences with a user-friendly graphical interface. This tool is named “SeqPacker” because it uses DNA/RNA sequences. In addition, SeqPacker can be seen as a kind of nucleotide chain editor using standardized technologies, nucleotide representation standards, and high platform portability in support of research in Genomic Epidemiology. SeqPacker is written in JAVA as free and stand-alone software for several computer platforms.
Modelo conceptual bioinformático aplicado al análisis genómico de las enfermedades cardiovasculares
Fundamento El analisis genomico actualmente necesita de la concurrencia de disciplinas muy alejadas del campo de la biologia molecular, entre ellas la ciencia de la computacion, base de la bioinformatica. Las herramientas bioinformaticas trabajan fundamentalmente con modelos abstractos de la informacion genomica. Este trabajo tiene por objetivo la obtencion de un modelo conceptual de la informacion genomica cuya finalidad es la construccion de sistemas de software bioinformaticos para el analisis de las enfermedades cardiovasculares. Metodos Se han aplicado 2 enfoques complementarios en ingenieria del software: el paradigma de la orientacion a objetos, aplicando el metodo unificado de desar…