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Modelo conceptual bioinformático aplicado al análisis genómico de las enfermedades cardiovasculares

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Fundamento El analisis genomico actualmente necesita de la concurrencia de disciplinas muy alejadas del campo de la biologia molecular, entre ellas la ciencia de la computacion, base de la bioinformatica. Las herramientas bioinformaticas trabajan fundamentalmente con modelos abstractos de la informacion genomica. Este trabajo tiene por objetivo la obtencion de un modelo conceptual de la informacion genomica cuya finalidad es la construccion de sistemas de software bioinformaticos para el analisis de las enfermedades cardiovasculares. Metodos Se han aplicado 2 enfoques complementarios en ingenieria del software: el paradigma de la orientacion a objetos, aplicando el metodo unificado de desarrollo de software y el lenguaje de modelado unified modelling language (UML; http://www.uml.org, http://www.omg.org ), asi como los sistemas multiagente, segun la inteligencia artificial distribuida. Resultados Considerando que tanto el gen como el genotipo o el fenotipo, entre otros, son entidades objetuales a modelar, se ha construido un modelo orientado a objetos para la gestion de la informacion genomica y cardiovascular. En este modelo se consideran tanto los elementos de informacion y las relaciones entre ellos (la vision estructural), como su comportamiento en el sistema en funcionamiento (la vision dinamica). Para modelar la interaccion entre los distintos factores (gen-gen y gen-ambiente) se ha considerado un modelo multiagente, donde cada factor esta representado por un agente elemental. Tambien se ha construido un pequeno prototipo correspondiente al subsistema de gestion de la informacion. Conclusiones Se ha obtenido un modelo conceptual para la construccion de herramientas bioinformaticas que apoyan al analisis genomico en las enfermedades cardiovasculares. El modelo presenta 2 vertientes: el enfoque orientado a objetos con UML para la arquitectura basica del sistema y el enfoque orientado a agentes para tratar las interacciones entre los factores geneticos y ambientales. El modelo es parte de un proyecto de mayor envergadura que pretende construir un sistema funcional completo denominado A-Genes.