0000000000975645
AUTHOR
Rebeka Ludviga
DAUDZZIEDU AIRENES RAIBUMA VĪRUSA SERĪNA PROTEĀZES STRUKTURĀLIE PĒTĪJUM
Bakalaura darbs tika izstrādāts no 2019. gada septembra līdz 2020. gada maijam Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrā, Augu virusoloģijas laboratorijā Dr. biol. Andra Zeltiņa un Dr. biol. Inas Baļķes vadībā. Pētījuma objekts ir daudzziedu airenes raibuma vīrusa serīna proteāze. Sobemovīrusu serīna proteāzes veic poliproteīnu 2a un 2ab šķelšanu pa specifiskiem šķelšanas saitiem funkcionālajos domēnos. Proteāžu katalītiskā centra triādes aminoskābes ir D-H-S, kuru nomaiņa samazina vai inaktivē to katalītisko darbību. 3D struktūra ir publicēta tikai Sesbānijas mozaīkas vīrusam. To veido divas β mucas, kas savienotas ar garu starpdomēnu cilpu. Proteāzes pieder pie glutamil-peptidāzēm,…
Smiltsērkšķu marafivīrusa kodēto proteīnu klonēšana, ekspresija un raksturošana
Smiltsērķšu marafivīruss (SBuMV) ir iepriekš neraksturots, smiltsērkšķus inficējošs vīruss. Tam ir divas atklātās translācijas fāzes (ORF), kur ORF1 kodē poliproteīnu, kas satur četrus proteīnu domēnus, bet ORF2 kodē apvalka proteīnu (CP). Šajā darbā tika izveidotas ekspresijas plazmīdas SBuMV kodētajiem proteīniem, taču E. coli sistēmā izdevās ekspresēt un attīrīt tikai abas CP formas un proteāzes (PRO) domēnu. Tika pārbaudīta PRO aktivitāte, PRO šķelšanas saits un verificēta PRO deubikvitināzes (DUB) aktivitāte. SBuMV mažorais CP E. coli spēj pašsavākties vīrusam līdzīgajās daļinās (VLP), bet minorais CP veido agregātus. Koekspresijas rezultātā, ja abas CP formas ekspresē no vienas plazmī…