0000000001263223
AUTHOR
Helvijs Niedra
Evaluation of the Possibility to Detect Circulating Tumor DNA From Pituitary Adenoma
Objective: Circulating free DNA (cfDNA) in general and circulating tumor DNA (ctDNA) in particular is becoming an increasingly used form of liquid biopsy biomarkers. In this study, we are investigating the ability to detect ctDNA from the plasma of pituitary adenoma (PA) patients. Design: Tumor tissue samples were obtained from planed PA resections, before which blood plasma samples were taken. Somatic variants found in PA tissue samples were evaluated in related cfDNA, isolated from plasma samples. Methods: Sanger sequencing, as well as previously obtained whole-exome sequencing data, were used to evaluate somatic variants composition in tumor tissue samples. cfDNA was isolated from the sa…
Micro-RNAs miR-375-3p and miR-7-5p are released alongside ACTH from corticotroph pituitary neuroendocrine tumor
AbstractObjectiveCirculating miRNAs are found in bodily fluids including plasma and can serve as biomarkers for diseases. The aim of this study was to provide the first insight into the landscape of circulating miRNAs in close proximity to the adrenocorticotropic hormone (ACTH) secreting PitNET. To achieve this objective next-generation sequencing of miRNAs in plasma from bilateral inferior petrosal sinus sampling (BIPSS) - a gold standard in diagnosing ACTH-secreting PitNETs, was carried out.MethodsSinistral (left) and dextral (right) BIPSS blood samples of the patient were collected in three time points: before the administration of corticotropin-releasing hormone, 5 and 15 minutes after …
Hipofīzes neiroendokrīno audzēju raksturīgo mikro RNS identificēšana un izpēte pacientu plazmā
Cirkulējošās plazmas mikro RNS (miRNS) ir plaši pētīts biomarķieris ļaundabīgo audzēju diagnostikā, bet saistībā ar hipofīzes neiroendokrīnajiem audzējiem (PitNET) tās ir maz izpētītas. Darbā, izmantojot nākamās paaudzes sekvencēšanu, tika analizētas miRNS izmaiņas pacientu plazmas paraugos pirms un 24 stundas pēc ekstirpācijas, kā arī novērtēts miRNS saturs plazmā no pacienta, kuram tika veikta bilaterālā inferioro petrozālo sinusu katetrizācija (BIPSS). Pirms un pēc ekstirpācijas cirkulējošo miRNS sastāvs tika analizētas 34 pacientos un diferenciālekspresijas analīzē statistiski būtiskas izmaiņas (P < 0,05) 24 stundas pēc PitNET ekstirpācijas tika detektētas 22 miRNS, no kurām 15 bija aug…
Ārpusšūnu cirkulējošo nukleīnskābju izpēte hipofīzes adenomas pacientos
Līdz šim literatūrā nav ziņojumu par ccfDNA un cirkulējošo miRNS izpēti HA pacientu plazmā. Darbā tika novērtēta iespējamība detektēt HA izcelsmes ccfDNA plazmā, veicot mērķētu NGS pozīcijās, kuras saturēja HA somatiskās mutācijas, un veikts pētījums par miRNS sastāva izmaiņu detektēšanu plazmā 24 stundas pēc HA rezekcijas. HA eksomos atklātās somatiskās mutācijas tikai detektētas septiņās no 16 pārbaudītajām pozīcijām ccfDNA amplikonos. Divās ccfDNA pozīcijās mutantā alēle bija vairāk nekā 2% no kopējā nolasījumu skaita, kas varētu liecināt par šo ccfDNA izcelsmi no HA. Piecās pozīcijās no diviem HA pacientiem mutantās alēles īpatsvars ccfDNA bija ap 50%, kaut gan šīs mutācijas netika kons…