6533b7d7fe1ef96bd126895d

RESEARCH PRODUCT

Visa genoma asociācija identificē ģenētiskos marķierus, kas saistīti ar hipofīzes adenomas risku un fenotipu

subject

description

Visa genoma asociācijas pētījumi(GWAS) ir pētījumu metode noteikta klīniskā stāvokļa ģenētiskā cēloņa noskaidrošanai, izmantojot genotipēšanas mikromasīvus un SNP nelīdzsvarotās saistības principu. Hipofīzes adenomas(HA) ir nemetastazējoši audzēji ar dažādu molekulāro izcelsmi. Līdz šim zināmas vairākas somatiskas mutācijas (GNAS, MEN1, USP8, GPR101), kas asociētas ar noteiktu HA klīnisko tipu klātbūtni, kā arī veikti kandidātgēnu pētījumi HA ģenētisko cēloņu noteikšanai. Līdz šim pasaulē veikts tikai viens GWAS pētījums, lai konstatētu ar HA tumoroģenēzi asociētos SNP Ķīnas Han populācijā. Šajā darbā izmantoja 233 HA un 468 kontroles indivīdu genotipus, tika noteikti ar palielinātu hipofīzes adenomas tumoroģenēzes risku un fenotipu asociētie SNP eiropiešu izcelsmes populācijā. Rezultātā iegūti 13 visa genoma līmeņa nozīmīguma HA asociēti SNP, no kuriem viens atradās vienā lokusā ar Ķīnas Han populācijā būtiski asociētajiem ģenētiskajiem marķieriem - MGMT gēnā. Vēl viens būtiski asociētais SNP (rs10837911) atrodas 1.25Mb attālumā no gēna LRRC4C, kurš mijiedarbojas ar gēnu LRRC4 un abu šo gēnu iespējamā iesaiste HA tumoroģenēzē literatūrā apskatīta jau iepriekš. Pārējo 11 SNP un to lokusu asociācija ar paaugstinātu HA risku, iespējams, ir saistīta ar šo SNP un tuvumā esošo gēnu iesaisti šūnas cikla, audzēju apspiešanas un transkripcijas regulācijā, signālpārnesē un lnciRNS ekspresijas izmaiņās. Šie rezultāti sniedz ieskatu HA ģenētiskajos cēloņos eiropiešu populācijā un paver iespējas turpmākiem potenciālo HA molekulāro cēloņu funkcionālajiem pētījumiem. Pētījums izstrādāts Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centra Cilvēka ģenētikas un molekulārās medicīnas grupas ietvaros no 2018. gada septembra līdz 2019. gada maijam.