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RESEARCH PRODUCT

A new set of DNA macrochips for the yeast Saccharomyces cerevisiae: features and uses

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The yeast Saccharomyces cerevisiae has been widely used for the implementation of DNA chip technologies. For this reason and due to the extensive use of this organism for basic and applied studies, yeast DNA chips are being used by many laboratories for expression or genomic analyses. While membrane arrays (macroarrays) offer several advantages, for many laboratories they are not affordable. Here we report that a cluster of four Spanish molecular-biology yeast laboratories, with relatively small budgets, have developed a complete set of probes for the genome of S. cerevisiae. These have been used to produce a new type of macroarray on a nylon surface. The macroarrays have been evaluated and protocols for their use have been optimized. La levadura Saccharomyces cerevisiae ha sido muy utilizada para el desarrollo de las tecnologías de chips de DNA. Por ese motivo, y porque es un organismo muy utilizado en investigación básica y aplicada, hay muchos laboratorios que usan chips de DNA para estudios genómicos o de expresión. Aunque el uso de macrochips en membrana presenta varias ventajas, su precio los pone fuera del alcance de muchos laboratorios. Aquí mostramos que un grupo de cuatro laboratorios españoles de biología molecular de levaduras ha desarrollado, con presupuestos relativamente bajos, un lote completo de sondas del genoma de S. cerevisiae, que se han usado para fabricar un nuevo tipo de macrochips sobre superficie de nailon. Se han evaluado estos macrochips y se han optimizado los protocolos para su uso. A levedura Saccharomyces cerevisiae tem sido muito utilizada para o desenvolvimento das tecnologias de chips de DNA. Por esse motivo, e por se tratar de um organismo largamente empregado em pesquisa básica e aplicada, existem muitos laboratórios que usam chips de DNA para os estudos genômicos ou de expressão. Embora o uso de macrochips em membrana apresente várias vantagens, seu preço os coloca fora do alcance de muitos laboratórios. Aqui mostramos que um grupo de quatro laboratórios de biologia molecular espanhóis, desenvolveram com insumos relativamente baixos, um lote completo de sondas para o genoma de S. cerevisiae, que foram usadas para fabricar um novo tipo de macrochips sobre a superficie de nailon. Esses macrochips foram avaliados e otimizados os protocolos para seu uso.