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Interactions plantes-microorganismes associées à la dynamique du fer dans la rhizosphère

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Diplôme : Dr. d'Université; Dans la rhizosphère, les prélèvements de fer ferrique, à la fois par les microorganismes et les plantes, associée à la faible disponibilité de cet ion dans les sols, contribuent à l‚intense compétition pour le fer ferrique observée dans la rhizosphère. Les résultats présentés aujourd‚hui sont ceux obtenus au cours de ma thèse. Les objectifs étaient (i) d‚évaluer l‚impact de la compétition pour le fer sur la microflore rhizosphérique, en modifiant la biodisponibilité du fer ferrique dans la rhizosphère via la plante, et (ii) d‚évaluer l‚influence de la microflore sur la santé et la croissance des plantes. La stratégie expérimentale suivie a consisté à comparer la microflore associée aux racines d‚un tabac sauvage et d‚un transgène surexpresseur de ferritine pour lequel, la quantité de fer stockée est augmentée. Deux approches ont été utilisées: (i) une approche moléculaire avec la caractérisation de la structure des communautés totales et des communautés de Pseudomonas, et (ii) une approche cultivable avec l‚étude de la diversité de populations de Pseudomonas spp. fluorescents. Les résultats obtenus ont montrés (i) une modification de l‚intensité de la compétition pour le fer dans la rhizosphère du transgène, et (ii) une modification de la microflore rhizosphérique associée par comparaison avec le type sauvage. Des isolats de Pseudomonas spp. présentant des caractères phénotypique et génotypique préférentiellement associés au transgène et exprimant une activité antagoniste in vitro à l‚encontre de deux champignons phytopathogènes ont été sélectionnés. L‚influence des ces isolats sur la santé et la croissance du tabac en présence du champignon Phytophthora est actuellement en cours d‚étude. En parallèle à ce travail, l‚influence de la pyoverdine produit par la souche modèle Pseudomonas fluorescens C7 sur la nutrition en fer de Arabidopsis thaliana a été étudiée. Les résultats ont montrés (i) une incorporation de fer en présence de ferri-pyoverdine chez un mutant knock out IRT1, éliminant la possibilité d‚implication de ce transporteur, et (ii) la présence de pyoverdine à l‚intérieur des tissus racinaires par ELISA et par un marquage isotopique de la pyoverdine avec de l‚azote 15N.