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DIAGSOL : Développement d’un outil microbien pour évaluer l’exposition des sols agricoles aux herbicides β-tricétones

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International audience; En 2011, en France, plus de 2 millions d’hectares de champs de maïs ont été traités avec desherbicides β-tricétones. Qualifiés de « respectueux de l’environnement » en raison d’une efficacité àfaible dose, de récentes études ont démontré un effet transitoire des β-tricétones sur la diversitébactérienne des sols (Romdhane et al., 2016). L’utilisation récurrente des β-tricétones pourrait, àterme, perturber la diversité bactérienne et les fonctions écosystémiques des sols qu’elle soutient.Il est essentiel d’évaluer l’exposition des microorganismes des sols aux β-tricétones.L’enzyme 4-hydroxyphénylpyruvate dioxygénase (4-HPPD), cible de ces herbicides chez les plantesadventices, est retrouvée chez de nombreuses bactéries. De ce fait, le gène hppd pourrait constituerun biomarqueur d’exposition. Afin d’explorer cette perspective, des couples d’amorces spécifiquesont été dessinés à l’aide des 1200 séquences hppd disponibles dans GenBank. Leur spécificité a étévalidée par le clonage et le séquençage d’amplicons générés à partir d’ADN bactérien extrait d’un sol.Des essais de qPCR visant à quantifier l’abondance des séquences hppd dans les sols ont étédéveloppés. Une expérience en microcosmes de sol exposés ou non à différentes doses desulcotrione est en cours. La dissipation de la sulcotrione dans le temps sera calculée et l’impactécotoxicologique de cet herbicide sur les bactéries sera estimé en quantifiant l’évolution del’abondance et de la diversité des séquences hppd. Nous prévoyons de réitérer cette approche enmicrocosmes à partir du DECANO®, produit formulé de la sulcotrione. Ces résultats seront présentésà la session EcotoxicoMic.