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Répercussions des dépérissements à Botryosphaeriacées au niveau des rameaux de vigne : étude spatio-temporelle aux échelles anatomique et physiologique

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Le dépérissement à Botryosphaeriacées est une maladie du bois de la vigne causée par deschampignons vasculaires. Ce dépérissement entraîne des pertes économiques importantes, d’autantqu’aucun traitement efficace n'est encore disponible. A l’heure actuelle, l'expression des symptômesfoliaires n'est pas encore entièrement comprise mais il n’est pas rare de trouver des Botryosphaeriacéesdans les premiers entre-nœuds des rameaux. Cependant, le lien entre leur présence et les symptômesfoliaires (défoliation apicale) n'est toujours pas établi.Dans ce travail, l'objectif a été d'évaluer les conséquences physiologiques et développementales dela présence de Botryosphaeriacées dans les entre-nœuds de la base de rameaux de vignessymptomatiques (forme défoliatrice) ou non. En 2018, sur une parcelle plantée en Cabernet Franclocalisée à Rodilhan (Gard), une expérimentation a été menée pour 3 stades phénologiques différents(floraison, petit pois et véraison). Pour chaque stade, les 3 entre-nœuds de la base des rameaux ont étéprélevés sur des vignes visuellement saines (témoin asymptomatique), et d’autres pré-symptomatiquesou symptomatiques (i.e. dépérissantes). Les échantillons collectés ont été utilisés pour (i) la détectiondes agents pathogènes (Botryosphaeriacées) par analyses pasteuriennes et PCR, (ii) l'estimation del'obstruction des vaisseaux du xylème par analyse d'images à partir d'observations macroscopiques, (iii)la caractérisation anatomique et structurale par analyse cytologique, (iv) l’analyse, par q-RT-PCR, del'expression de transcrits liés à la réponse de défense des plantes et à la mise en place / activité desméristèmes secondaires et (v) la quantification de métabolites par GC-MS.La présence de Botryosphaeriacées a été observée tant dans les ceps asymptomatiques quesymptomatiques. En ce sens, ce critère ne peut expliquer à lui seul l’apparition des symptômes. Demanière intéressante, nous avons pu rapporter des modulations structurales et moléculaires dès la phasepré-symptomatique. En effet, à ce stade si le bois secondaire présente des évènements ponctuels dethyllose, le liber secondaire présente quant à lui des altérations profondes (liber mou désorganisé etplages criblées obstruées par de la callose). De plus, les rayons libériens et ligneux montrent unediminution de la présence d’amyloplastes, témoignant d’une moins bonne mise en réserve dans lesrameaux de ceps dépérissants. A l’échelle moléculaire et pour ce même temps (pré-symptomatique),nous observons une augmentation de l’expression de transcrits associés aux défenses (GLU, TL, PR6,POX4) et au métabolisme des sucres (a-AMY, CWIN), tant dans le bois que dans le liber. De façoncohérente avec les observations structurales, une augmentation de l’expression de transcrits associés àla synthèse de callose phloémienne (CalS7) est observée dans le liber. Enfin, une discriminationmétabolique peut également être notée, avec notamment une accumulation préférentielle d’asparagine(bois et liber) et de glutamine (liber) dans les rameaux asymptomatiques, et une accumulationpréférentielle de glycosylsalicylate (liber) dans les rameaux pré-symptomatiques. En phase d’expressiondes symptômes, les différences s’accentuent sur l’ensemble des échelles d’observations. Lesévènements de thyllose et d’altération libérienne sont plus marqués et un défaut de mise en place del’aoûtement est rapporté. A l’échelle moléculaire, une répression de l’expression des transcrits associésà l’activité cambiale (MOL, WOX4 et CDKB2), comme à la mise en place du phellogène (APL et SHR)est observée. Enfin, une diminution de la teneur en 1-kestose (fructo-oligosaccharide) est rapportée. Cestranscrits ou métabolites, impliqués dans l’immunité végétale ou la qualité des bois, pourraient servir àl’avenir de bio-indicateurs des dysfonctionnements associés à ce dépérissement.