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RESEARCH PRODUCT

Étude et modélisation des impacts des pratiques agricoles sur la dynamique de la distribution des communautés microbiennes des sols à l’échelle du paysage

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National audience; Les micro-organismes telluriques, de par leur abondance et leur richesse, jouent un rôle centraldans le fonctionnement des écosystèmes et sont des bioindicateurs intéressants pour évaluerl’impact des pratiques agricoles sur la qualité des sols. L’enjeu est de favoriser leur utilisationpour accompagner l’innovation dans le monde agricole. Cette thèse a pour objectif de permettreune meilleure compréhension des dynamiques spatiales et temporelles des communautésmicrobiennes du sol à l’échelle du paysage. Pour cela, nous proposons de modéliser cesdynamiques et de partager les connaissances aux acteurs du monde agricole via un OAD (outild’aide à la décision). Le paysage de Fénay (1200ha, Dijon) est un terrain d’expérimentationpermettant de répondre à ces objectifs au travers d’un échantillonnage intensif (267 points en2011, 2016 et 2019) qui caractérise les communautés microbiennes et les paramètres physicochimiquesdu sol en regard de l’inventaire réalisé sur les pratiques agricoles. L’abondance descommunautés microbiennes et la richesse procaryotique suivent une distribution spatialehétérogène au sein du paysage et varient localement au cours du temps. Les ressources du solcomme les pratiques agricoles impactent l’abondance et la diversité microbienne de manièresdifférentes. Des dépendances temporelles des communautés microbiennes aux pratiquesagricoles antérieures ont été observées, traduisant des effets cumulatifs et de précédent. En nousreposant sur des données multi-sources, un modèle multi-agents intégrant des paradigmesécologiques et sociaux a été développé et permet d’anticiper les impacts des pratiques agricolessur plusieurs années. Sa validation est réalisée via une exploration du modèle et des ateliersparticipatifs.