6533b871fe1ef96bd12d141a

RESEARCH PRODUCT

Subtelomēru rajona hromatīna struktūras izmaiņu noteikšana ar qPCR

subject

description

Cilvēka subtelomēri ir izteikti polimorfiski un ir ar vislielāko gēnu blīvumu visā genomā. Subtelomēru sekvences pārmaiņas ir saistītas ar mentālo atpalicību, ļaundabīgām hematoloģiskajām slimībām, atkārtotiem spontānajiem abortiem un citām slimībām. Tādēļ subtelomēru reģiona pārmaiņu konstatēšana ir svarīga klīniskās izpētes sastāvdaļa. Subtelomēru pētniecībā galvenokārt tiek pielietotas divas metodes: FISH un SAT. Šajā darbā tika aprakstīta qPCR metode subtelomēru analīzei, kas, teorētiski ir lētāka, ātrāka un precīzāka alternatīva FISH un SAT metodēm. Darbā apraksta qPCR metodes pielietošanu, Y hromosomas p pleca subtelomēru reģiona pārmaiņu pētīšanai, 34 DNS paraugiem, kas iegūti no neauglīgiem vīriešiem. Kā arī, lai pārbaudītu metodes efektivitāti, analizēti 5 DNS paraugi, kas iegūti no „Bērnu klīniskās universitātes slimnīcas” un kuriem jau ir konstatētas subtelomēru delēcijas, pielietojot FISH metodi. No pieciem DNS paraugiem, kuros tika konstatētas delēcijas ar FISH, četros, ar qPCR metodi tās arī tika detektētas. Kas pierāda to, ka metode var pielietot subtelomēru pārmaiņu pētniecībā. Pētot 34 paraugus, kas tika iegūti no neauglīgiem vīriešiem, 7 tika detektētas delēcijas un 1 tika detektēta duplikācija.