Search results for "Bactérie"

Coopération entre des bactéries solubilisatrices de phosphate et le champignon mycorhizien à arbuscule Rhizophagus irregularis dans la nutrition phos…

2019

National audience; Le phosphore est un élément essentiel pour le développement des plantes. Néanmoins, la majorité des ions phosphate est incorporée dans des structures organiques (Po) et inorganiques (Pi) insolubles qui rende cet élément très peu disponible pour les plantes et en particulier pour la pomme de terre (Solanum tuberosum). Dans les sols, le phytate (molécule de réserve phosphatée des plantes), est une source essentielle. Pour accéder au phosphate, les plantes ont développé des symbioses mutualistes à bénéfices réciproques avec des microorganismes de la rhizosphère capables d’extraire le P. Dans ce contexte, les objectifs de cette étude étaient de i) déterminer si la disponibili…

Optimisation du pyroséquençage haut-débit pour caractériser la diversité taxonomique des communautés bactériennes des sols

2011

Affiche, résumé; International audience; La diversité microbienne d’un sol (que l’on estime entre 100 000 et 1 000 000 d’espèces différentes par gramme de sol) est difficile à caractériser. Toutefois, d’importantes avancées en biologie moléculaire, comme le développement du pyroséquençage, ont permis d'obtenir plusieurs centaines de milliers de séquences à partir d’un ADN méta-génomique. Ces nouveaux développements permettent maintenant de caractériser la diversité des communautés microbiennes du sol en se basant sur un marqueur phylogénétique comme l'ADNr 16S, aussi appelée MetaTaxogénomique (Maron et coll., 2011). Toutefois, dans un contexte ou l’écologie microbienne du sol commence à s’a…

Primary succession changes diversity, abundance and function of soil microorganisms across glacier forelands

2010

La biodiversité de la microflore du sol prévient l’implantation de pathogènes alimentaires dans les sols agricoles

2015

Pôle EA MERS; National audience; La présence dans les agroécosystèmes de bactéries pathogènes pouvant être transmises à l’homme représente un risque sanitaire pour l’ensemble de la filière de production des aliments. Le sol est en effet une zone de transfert potentiel de ces agents pathogènes vers les matières premières agricoles, puis vers les produits agroalimentaires, la plupart du temps dans des produits animaux, mais aussi via des produits végétaux également.

La nature du sol et la composition floristique comme facteurs de modulation de la diversité et de la fonctionnalité des communautés microbiennes en p…

2019

National audience; La composition floristique, le mode d’exploitation (fauche, pâturage), l’intensité d’exploitation (chargement, fréquence des coupes, fertilisation) et la pérennité de la couverture végétale sont connus comme étant des facteurs déterminants du fonctionnement des prairies permanentes (Gaujour et al. 2012). Ces pratiques de gestion peuvent modifier les stocks de C directement en modulant les entrées de matières organiques (MO) (litière et/ou effluents d’élevage) et indirectement en orientant la composition et le fonctionnement des communautés végétales ce qui pourrait agir sur le temps de résidence et la localisation de la MO (Hassink et Neeteson 1991). Ce projet a pour obje…

La métaprotéomique pour l'analyse fonctionnelle des communautés bactéreinnes indigènes

2007

Etude comparative de deux méthodes de transformation et de deux milieux de culture chez Agrobacterium tumefaciens souche LBA4404

2013

Rapport de stage de master 1 BAP GEAPSI

Dispersal potential of antibiotrophy along the manure-soil-sediment continuum of sulfamethazine-contaminated agrosystems

2021

An emerging function in the scientific literature, antibiotrophy is the bacterial capacity to metabolize antibiotics. Considered a bioremediation tool, it remains a health risk due to its association with antibiotic resistance. The first goal of this thesis was to study its dispersion within agrosystems contaminated with antibiotics during two coalescence events, i.e. manure spreading on the soil and its erosion towards the aquatic compartment. Experiments have shown the systematic invasion of the soil and sediment bacterial communities by the antibiotroph Microbacterium sp. C448 when sulfamethazine is present but not necessarily mineralized. The antibiotic would have a double function towa…

Sélection artificielle de communautés microbiennes : effet de la diversité génétique et rôle des interactions interspécifiques

2021

National audience; La sélection artificielle, à l'origine des espèces animales et végétales utilisées en agriculture, alongtemps été appliquée à l’échelle de l’individu. Il est possible de transposer cette procéduresur des holobiontes, communautés ou écosystèmes ; toutefois, cela ajoute un niveau decomplexité puisque le phénotype cible de la sélection résulte de la présence de plusieurs espèceset, potentiellement, de leurs interactions. L'ambition de ce projet est i) de déterminer si unediversité génétique microbienne élevée permet d'améliorer l'efficacité de la sélection artificiellede communautés microbiennes et ii) de déterminer si les interactions entre espèces sontimpliquées dans la mi…

Services provided by soil microorganisms to improve plant phosphate nutrition

2022

Since the first Green Revolution, agricultural practices have been based on the massive use of synthetic fertilisers and plant protection products. Since then, global consumption of phosphate fertilisers has more than tripled, reaching 47 million tonnes in 2019. Current projections estimate that phosphate rock stocks (natural phosphorus resources for fertiliser production) could be depleted within the next century, leading us to change our agricultural practices. In soils, P is mainly present in complexed forms that are not easily accessible to plants. To reduce the use of phosphate fertilisers, it is necessary to make this complexed phosphate accessible to plants. This can be done by benef…