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Análisis poblacional y filogeográfico de vectores de la enfermedad de Chagas en Perú basado en análisis multigénicos del ADN ribosomal y mitocondrial

2017

La enfermedad de Chagas, cuyo agente causal es Trypanosoma cruzi, constituye un grave problema de salud pública en toda Latinoamérica. La principal forma de transmisión es la vectorial, de la que son responsables hemípteros redúvidos de la subfamilia Triatominae adaptados a los hábitats doméstico y peridoméstico. Puesto que el parásito se mantiene en un ciclo zoonótico silvestre y es imposible de eliminar, la principal forma de lucha contra la transmisión vectorial consiste en la eliminación de las poblaciones domiciliadas del vector. Los estudios moleculares constituyen una herramienta de gran utilidad a la hora de planificar las campañas de control vectorial, puesto que permiten conocer y…

perúfilogeniatriatominaeadn ribosomal (its-1 5.8s its-2):CIENCIAS MÉDICAS ::Patología::Parasitología [UNESCO]filogeografiaUNESCO::CIENCIAS MÉDICAS ::Patología::Parasitologíaadn mitocondrial (16s nd1 coi cytb)genética poblacionalhaplotipaje molecularenfermedad de chagas
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Soluciones bioinformáticas para el análisis de datos ómicos, descubrimiento de conocimiento y diagnóstico genético en Sparus aurata y otros organismo…

2023

Esta tesis ha sido financiada por el Ministerio de Ciencia e Innovación a través de la ayuda “DI-17-09134” para contratos para la formación de doctores en empresas (Doctorados Industriales). Con el incremento de datos generados mediante el uso de las tecnologías de secuenciación, es necesario el diseño de protocolos y herramientas que permitan el análisis y la integración de los mismos con el objetivo de entender y comprender los sistemas biológicos que forman parte de cada estudio en particular. Estas herramientas, además, es preferible que sean intuitivas y de fácil manejo para los usuarios, de manera que puedan ser utilizadas por cualquier investigador y no solamente por aquellos que sea…

UNESCO::CIENCIAS DE LA VIDA::Genética::Bioinformáticabioinformáticarna-seqhaplotipos víricosmicrobiotabiología de sistemasUNESCO::CIENCIAS DE LA VIDA::Genética::Genómica computacionaltranscriptómicaUNESCO::MATEMÁTICAS::Estadística ::Análisis de datosgenómicaUNESCO::MATEMÁTICAS::Ciencia de los ordenadores::Inteligencia artificialredes bayesianas
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Diversidad genética de los principales vectores de la enfermedad de Chagas en Brasil: repercusiones epidemiológicas en el control de la enfermedad

2017

La enfermedad de Chagas, también llamada Tripanosomiasis Americana, es una enfermedad potencialmente mortal causada por el parásito protozoo Trypanosoma cruzi, es endémica de América Latina y transmitida, principalmente, por vectores hemípteros de la subfamilia Triatominae adaptados a los hábitats doméstico y peridoméstico. Puesto que el parásito se mantiene en un ciclo zoonótico silvestre y es imposible de eliminar, la única forma de luchar contra la transmisión vectorial consiste en la eliminación de las poblaciones domiciliadas del vector. Los estudios moleculares constituyen una herramienta de gran utilidad a la hora de planificar las campañas de control vectorial, puesto que permiten c…

triatominae16sits-2brasilcytbenfermedad de chagasits-1análisis filogenéticos:CIENCIAS MÉDICAS ::Patología::Parasitología [UNESCO]nd1co1UNESCO::CIENCIAS MÉDICAS ::Patología::Parasitologíacontrol vectorialhaplotipaje molecular
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The systemic lupus erythematosus IRF5 risk haplotype is associated with systemic sclerosis.

2013

Systemic sclerosis (SSc) is a fibrotic autoimmune disease in which the genetic component plays an important role. One of the strongest SSc association signals outside the human leukocyte antigen (HLA) region corresponds to interferon (IFN) regulatory factor 5 (IRF5), a major regulator of the type I IFN pathway. In this study we aimed to evaluate whether three different haplotypic blocks within this locus, which have been shown to alter the protein function influencing systemic lupus erythematosus (SLE) susceptibility, are involved in SSc susceptibility and clinical phenotypes. For that purpose, we genotyped one representative single-nucleotide polymorphism (SNP) of each block (rs10488631, r…

MaleLinkage disequilibrium:Phenomena and Processes::Genetic Phenomena::Phenotype [Medical Subject Headings]Polimorfismo de nucleótido simpleSLElcsh:MedicineAutoimmunityGenome-wide association studyLinkage DisequilibriumScleroderma:Phenomena and Processes::Genetic Phenomena::Genotype::Haplotypes [Medical Subject Headings]:Organisms::Eukaryota::Animals::Chordata::Vertebrates::Mammals::Primates::Haplorhini::Catarrhini::Hominidae::Humans [Medical Subject Headings]Gene Frequency:Named Groups::Persons::Population Groups::Continental Population Groups::European Continental Ancestry Group [Medical Subject Headings]Risk FactorsIRF5Genetics of the Immune SystemLupus Erythematosus Systemic:Diseases::Skin and Connective Tissue Diseases::Skin Diseases::Scleroderma Systemic [Medical Subject Headings]skin and connective tissue diseaseslcsh:ScienceMultidisciplinary:Diseases::Immune System Diseases::Autoimmune Diseases::Lupus Erythematosus Systemic [Medical Subject Headings]Predisposición genética a la enfermedad:Phenomena and Processes::Genetic Phenomena::Genetic Linkage::Linkage Disequilibrium [Medical Subject Headings]:Phenomena and Processes::Genetic Phenomena::Genotype::Genetic Predisposition to Disease [Medical Subject Headings]PhenotypeInterferon Regulatory FactorsSYSTEMIC SCLEROSISMedicineEvaluation of complex medical interventions Auto-immunity transplantation and immunotherapy [NCEBP 2]FemaleIRF5; SLE; TYPE I INTERFERON; SYSTEMIC SCLEROSISHaplotiposResearch ArticleFactores de riesgoImmunology:Chemicals and Drugs::Amino Acids Peptides and Proteins::Peptides::Intracellular Signaling Peptides and Proteins::Adaptor Proteins Signal Transducing::Interferon Regulatory Factors [Medical Subject Headings]:Check Tags::Male [Medical Subject Headings]:Health Care::Environment and Public Health::Public Health::Epidemiologic Factors::Causality::Risk Factors [Medical Subject Headings]Single-nucleotide polymorphismHuman leukocyte antigenBiologyPolymorphism Single NucleotideWhite PeopleAutoimmune DiseasesRheumatologyLupus eritematoso sistémicoGeneticsHumansGenetic Predisposition to DiseaseGrupo de ascendencia continental europeaAlleleBiologyAllele frequencyAllelesGenetic Association Studies:Phenomena and Processes::Genetic Phenomena::Genetic Structures::Genome::Genome Components::Genes::Alleles [Medical Subject Headings]Scleroderma SystemicHaplotypelcsh:R:Phenomena and Processes::Genetic Phenomena::Genetic Structures::Genome::Genome Components::Genetic Loci [Medical Subject Headings]Human Genetics:Phenomena and Processes::Genetic Phenomena::Genetic Variation::Polymorphism Genetic [Medical Subject Headings]Factores reguladores del interferónHaplotypesDesequilibrio de ligamiento:Check Tags::Female [Medical Subject Headings]Genetic LociTYPE I INTERFERONGenetics of DiseaseImmunologyGenetic PolymorphismClinical Immunologylcsh:Q:Phenomena and Processes::Genetic Phenomena::Gene Frequency [Medical Subject Headings]Population GeneticsIRF5PLoS ONE
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Cilvēka 14. hromosomas proteasomu gēnu polimorfismu asociāciju ar multiplo sklerozi izpēte Latvijas populācijā

2018

Proteasomālo gēnu polimorfismi ir autoimūnu slimību riska faktori. Lai novērtētu potenciālus multiplās sklerozes (MS) biomarķierus Latvijas populācijā, veicām proteasomālo gēnu PSMA6 un PSMC6 polimorfismu genotipēšanu 280 pacientiem ar MS diagnozi, ko salīdzinājām ar iepriekš ievāktiem datiem no 305 kontrolēm ar mērķi izpētīt iespējamo asociāciju starp šo lokusu polimorfismiem un MS. Tālākā analīzē kombinācijā ar iepriekšējiem PSMA3 polimorfismu genotipēšanas datiem atradām divus klīniski nozīmīgus multi-lokusu genotipus un trīs klīniski nozīmīgus haplotipus. Daļai pētīto polimorfismu novērojām no alēlēm atkarīgas alternatīvas DNS sekundārās struktūras. PSMA6 rs1048990 polimorfisma minorajā…

viena nukleotīda polimorfismigadījuma-kontroles pētījumsproteasomasBioloģijamultilokusu genotipi un haplotipimultiplā skleroze
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Neolithic mitochondrial haplogroup H genomes and the genetic origins of Europeans

2013

Brotherton, Paul et al.-- The Genographic Consortium

Haplogroup L4aHaplogroup MHaplogroup NTime FactorsHaplogroup HMolecular Sequence DataGeneral Physics and AstronomyADN mitocondrialBiologyGenoma humàGeneral Biochemistry Genetics and Molecular BiologyWhite PeopleArticleEvolution MolecularFilogèniaNeolíticHumansHaplogroup D-M15EuropeusPhylogenyDemographyGeneticsPrincipal Component AnalysisMultidisciplinaryBase SequenceGenome HumanGeneral ChemistryHaplogroup L3Sequence Analysis DNAHaplogroup IJHaplotipGenetics PopulationHaplotypesEvolutionary biologyGenome MitochondrialHuman mitochondrial DNA haplogroupNature Communications
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