Search results for "Holobiont"
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L’holobionte vigne, un levier biologique pour lutter contre les dépérissements ?
2021
National audience; Le concept d’organisme pluricellulaire isolé montre actuellement ses limites. En effet, unorganisme interagit avec différentes communautés microbiennes (constituant son microbiote)qui modulent ses propriétés, telles que sa physiologie (ex. réponse à une attaque pathogène).L’association hôte-microorganismes définit un holobionte, dont le fonctionnement est influencépar la dynamique spatio-temporelle de leurs interactions. Ainsi, un dysfonctionnement del’holobionte vigne (par exemple lié à des pratiques culturales inadaptées ou aux changementsclimatiques) pourrait entraîner le développement de maladies ou de désordres physiologiques,sources de dépérissements, de la même man…
Caractérisation de l’holobionte vigne : des bio-indicateurs du dépérissement du sol aux feuilles
2018
Le projet HOLOVITI porte sur l’holobionte (du grec holo = tout et bios = vie), c’est-à-dire l’unité biologique composée de l’hôte (ici la vigne) et tous les microorganismes avec lesquels la plante interagit et établit un dialogue. « Nous étudions le lien physiologique entre le microbiote et le cep, depuis le sol jusqu’aux feuilles, précisent Pierre-Emmanuel Courty (INRAE Dijon Bourgogne Franche Comté) et Sophie Trouvelot (Institut Universitaire de la Vigne et du Vin -Université de Bourgogne), co- porteurs de ce projet. Le projet HOLOVITI a pour objectif majeur d’identifier des bio-indicateurs d’origine végétale et microbienne qui traduiraient l’état sanitaire et physiologique de la vigne et…
Compréhension et valorisation des interactions entre plantes et microorganismes telluriques : un enjeu majeur en agroécologie
2015
National audience; La libération d’une part significative des produits de photosynthèse de la plante sous forme de rhizodépôts constitue une source majeure de composés organiques pour la microflore hétérotrophe du sol qui est principalement en état de stase du fait de la forte compétition nutritionnelle régnant au niveau du sol. Parmi l’immense biodiversité tellurique, la plante sélectionne des populations particulières bien adaptées à l’environnement rhizosphérique et qui diffèrent selon le génotype de la plante. Cette sélection repose sur l’aptitude des populations microbiennes à tirer au mieux profit des composés organiques libérés, mais également sur une signalisation moléculaire à l’or…
Contribution to the research of microbial and RedOx bio-indicators for the early characterisation of wood diseases in grapevines
2022
Grapevine trunk diseases, linked to pathogenic fungi whose mechanism of action is still poorly characterised, are responsible for grapevine decline in vineyards throughout the world, causing significant losses in productivity and yield in the wine sector. Given the current lack of effective solutions to stop the establishment of the disease and the development of symptoms, which are irreversible but often late in relation to the pathogenic infection, early diagnosis of these diseases is essential. Considering the grapevine holobiont, i.e. the grapevine and the microbiota interacting with, we hypothesise that early bio-indicators of diseases would make it possible to identify a disturbance i…
Répercussions spatiales de l’esca sur l’holobionte vigne : réponse du microbiome dans le continuum sol/feuilles
2021
Dans le cadre du projet Holoviti (Plan National Dépérissement du Vignoble), l’holobionte vigne est étudié, dans le continuum sol - racines - parties aériennes (SRP), chez des ceps symptomatiques (S) ou asymptomatiques (AS) de la forme lente d’esca (tigrures foliaires). Ces recherches ont été réalisées sur une parcelle du château de Marsannay, située sur la commune de Couchey en Côte d’Or (21). Celle-ci a été choisie car elle présente simultanément trois types de dépérissements : deux liés à des agents pathogènes, respectivement viraux (agent du court-noué) et fongiques (agents de l’esca), et un lié à des dysfonctionnements physiologiques (porte-greffe 161-49C). Cette parcelle a été cartogra…
Assembly and functioning of endophytic bacterial communities in arcto-alpine pioneer plant Oxyria digyna
2019
Plant microbiomes consist of diverse communities of microorganisms, among which bacteria are highly abundant. The microbiomes are crucial for plants as they rely on their microbial associates for many essential functions. The goal of this thesis was to study the functional diversity and assembly rules of endophytic bacterial communities in different plant tissues of the arcto-alpine pioneer plant species, Oxyria digyna. I used high-throughput sequencing and bacterial isolations to characterize the endophytic communities in the leaves and roots of native O. digyna plants (wild plants) and micropropagated aseptic plants (bait plants) in the field. Wild plants and tissue-propagated bait plants…