Search results for "Microbiologie"
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Animation scientifique et technique sur "La microbiologie moléculaire au service du diagnostic environnemental"
2017
INRA EA BIOmEINRAEABIOmE; Dans une société où il devient urgent de réduire l’empreinte environnementale des activités humaines, l’établissement d’un diagnostic fiable de la qualité des divers écosystèmes (terrestres, aquatiques, atmosphériques) est une priorité absolue. Les microorganismes, de par leur petite taille, leur énorme diversité taxonomique et fonctionnelle, leurs capacités d’adaptations aux perturbations et leur forte implication dans les cycles biogéochimiques sont des candidats incontournables pour élaborer ce diagnostic
Plateforme GenoSol : une structure logistique d'appui à la recherche sur la microbiologie des sols et de l'environnement
2012
EA SPE GenoSol EcolDur CT3; Les communautés microbiennes du sol sont difficiles à caractériser. Ceci s’explique par une accessibilité plus ou moins importante des populations au sein d’une matrice hétérogène et structurée mais aussi par leur densité et diversité très importante qui rend difficile à résoudre l’information obtenue. Toutefois, grâce aux avancées méthodologiques qui ont eu lieu depuis une quinzaine d’années, les études d’écologie microbienne bénéficient maintenant d’une automatisation des outils moléculaires (extraction d’ADN, caractérisation du polymorphisme de l’ADN, séquençage haut débit, métagénomique, métaprotéomique…) permettant la caractérisation des ressources génétique…
Discovering lactic acid bacteria by genomics
2002
International audience; This review summarizes a collection of lactic acid bacteria that are now undergoing genomic sequencing and analysis. Summaries are presented on twenty different species, with each overview discussing the organisms fundamental and practical significance, environmental habitat, and its role in fermentation, bioprocessing, or probiotics. For those projects where genome sequence data were available by March 2002, summaries include a listing of key statistics and interesting genomic features. These efforts will revolutionize our molecular view of Gram-positive bacteria, as up to 15 genomes from the low GC content lactic acid bacteria are expected to be available in the pu…
Rôle de la sphère orale
2013
National audience
Mise en place d’outils et de bio-indicateurs pertinents de la qualité des sols (Chapitre 9)
2017
Mise en place d’outils et de bio-indicateurs pertinents de la qualité des sols (Chapitre 9)
Effet de la substitution d'essence sur le fonctionnement et la durabilité des écosystèmes forestiers : l'apport des travaux pluridisciplinaires menés…
2007
National audience; Le site-atelier de Breuil (Morvan), appartenant à l’Observatoire de Recherche sur l’Environnement F-ORE-T, est un support opérationnel des travaux actuels sur les cycles biogéochimiques en relation avec la diversité biologique du sol. De nombreux projets multidisciplinaires sont en cours sur ce site dont l’objectif commun est d’améliorer les connaissances sur les effets physiques, chimiques et biologiques des substitutions d’essences. Des travaux y sont menés à différentes échelles temporelles et spatiales, de l’instantané au pluriannuel, du microsystème fonctionnel jusqu’à l’écosystème complet. Les travaux développés à Breuil depuis 2001, montrent que les essences ont af…
La biopréservation: une stratégie d’avenir pour la conservation des aliments
2015
N° d'article 201511121820; La demande grandissante des consommateurs pour des produits alimentaires à teneur réduite en conservateurs pousse les industriels de l’agroalimentaire à rechercher des méthodes de conservation alternatives. Dans ce contexte, la bioprotection s’impose comme un procédé à fort potentiel. Cette technique consiste à inoculer sur les aliments des cultures de bactéries protectrices. Celles-ci, par l’intermédiaire de plusieurs mécanismes, vont inhiber la croissance de bactéries pathogènes et d’altération telles que Listeria monocytogenes et Salmonella. Cependant, cette technique n’a pas d’effet sur les spores bactériennes. Ainsi, l’objet central du projet de recherche ANR…
Regulatory networks underlying mycorrhizal development delineated by genome-wide expression profiling and functional analysis of the transcription fa…
2017
Background: Ectomycorrhizal (ECM) fungi develop a mutualistic symbiotic interaction with the roots of their host plants. During this process, they undergo a series of developmental transitions from the running hyphae in the rhizosphere to the coenocytic hyphae forming finger-like structures within the root apoplastic space. These transitions, which involve profound, symbiosis-associated metabolic changes, also entail a substantial transcriptome reprogramming with coordinated waves of differentially expressed genes. To date, little is known about the key transcriptional regulators driving these changes, and the aim of the present study was to delineate and functionally characterize the trans…
Influence of microbial diversity on soil organic carbon dynamics highlighted by a 13C-labelling technique
2012
Soil organic matter (SOM) represents the main pool of carbon within the biosphere, estimated at roughly twice that in atmospheric CO2. In agrosystems, organic amendments are common to maintain soil C stocks. However, recent studies have revealed that these practices can lead to a priming effect, corresponding to enhanced release of CO2 into the atmosphere, due to over-mineralisation of soil organic carbon. Therefore, appropriate decisions regarding organic input management require better understanding of the biogeochemical cycles related to SOM dynamics. As soil microorganisms are major actors in SOM turnover, their diversity is likely to influence SOM dynamics. In this context, the relatio…
Procedures and protocol for soil biodiversity monitoring : ‘RMQS-Biodiv', a french pilot area experience.
2008
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