Search results for "PADC"
showing 4 items of 4 documents
Low energy electrons and swift ion track structure in PADC
2015
The current work aims at providing an accurate description of the ion track-structure in poly-allyl dyglycol carbonate (PADC) by using an up-to-date Monte-Carlo code-called TILDA-V (a French acronym for Transport d'Ions Lourds Dans l'Aqua & Vivo). In this simulation the ion track-structure in PADC is mainly described in terms of ejected electrons with a particular attention done to the Low Energy Electrons (LEEs). After a brief reminder of the most important channels through which LEEs are prone to break a chemical bond, we will report on the simulated energetic distributions of LEEs along an ion track in PADC for particular incident energies located on both sides of the Bragg-peak position…
Radial electron fluence around ion tracks as a new physical parameter for the detection threshold of PADC using Geant4-DNA toolkit
2018
International audience; The detection threshold of poly(allyl dyglycol carbonate), PADC, for C ions is determined as 55 eV/nm in stopping power, which is significantly higher than that for proton and He ions. The stopping power is not a universal parameter for expressing the detection threshold of PADC. A new physical parameter of Radial Electron Fluence around Ion Tracks, REFIT, is proposed to describe the detection threshold of PADC. It is defined as the number density of electrons passing through the surface of a cylinder of a certain radius that is co-axial with the trajectory. Furthermore, preliminary calculations are presently being performed using the Monte Carlo simulation code of G…
Cat gēna transkripcijas starta saita noteikšana plazmīdās ar dažādu IS10 transpozonu lokalizāciju
2019
Insercijas secības (IS) ir transpozētspējīgas sekvences, dēļ kuras var notikt genomiskā pārkārtošanās, kā rezultātā var tikt aktivēti citi gēni. Baktērijās šis fenomens ļauj aktivizēt antibiotiku rezistences kodējošos gēnus. Šī darba mērķis bija noskaidrot cat gēna transkripcijas starta saitu jeb +1 RNS plazmīdās ar dažādu IS10H lokalizāciju, vienlaikus optimizējot Rapid Amplification of cDNA Ends (RACE) metodi. Tika izmantoti Escherichia coli celmi, kas bija transformēti ar plazmīdu DNS. No transformantiem tika izdalīta mRNS ar kuru tika veikta RACE metode. Sekvencēšanas rezultāti parādija, ka izmantotā metode bija efektīva, lai iegūtu 5’-galu no transkriptiem. Izdalītajos paraugos apstipr…
Hloramfenikola selektīvā spiediena ietekme uz acetiltransferāzes gēna aktivēšanu pAdCat plazmīdā Escherichi coli kultūras stacionārā fāzē
2015
IS10 ir viens no aktīvākajiem transpozoniem, kas nodrošina adapatīvo mutaģenēzi baktērijām, aktivizējot neekspresējošus gēnus. Darba mērķis bija noskaidrot hloramfenikola selektīvā spiediena ietekmi uz IS10 elementa spēju efektīvāk aktivizēt bezpromotera acetiltransferāzes (cat) gēnu pAdCat plazmīdā Escherichia coli kultūras stacionārā augšanas fāzē. Baktēriju celmi tika transformēti ar pAdCat plazmīdu, kas kalpo par vektoru-lamatu IS10 elementu izolēšanai pēc pozitīvās selekcijas principa. Šūnām, atrodoties trīs dienas stacionārajā fāzē, novēroja IS10 transpozīciju un bezpromotera hloramfenikola acetiltransferāzes (cat) gēna aktivizēšanu. Gēna aktivizēšanu nodrošināja gan IS10R, gan IS10H.…